RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	SLM2	P53955	656 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PLB2	Q03674	706 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RTT103	Q05543	409 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	POS5	Q06892	414 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5.09	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	KAE1	P36132	386 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	AIM29	P36154	155 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RPP1	P38786	293 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HPA3	P39979	161 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	COG3	P40094	801 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HIT1	P46973	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MKC7	P53379	596 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CWC27	Q02770	301 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YDR109C	Q04585	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ATX2	Q12067	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PNS1	Q12412	539 aa		5.08	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	COX3	P00420	269 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PBN1	P25580	416 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GAC1	P28006	793 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PPA2	P28239	310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MRPL15	P36523	253 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SOL2	P37262	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	APL3	P38065	1025 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SWM2	P40342	146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ALG8	P40351	577 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YIL024C	P40543	189 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ATG18	P43601	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ATG27	P46989	271 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TAX4	P47030	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TIM13	P53299	105 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	BUD32	P53323	261 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YDR262W	Q12331	272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MHF2	Q3E829	80 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	UBR2	Q07963	1872 aa		5.07	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MET3	P08536	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YSR3	P23501	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CDC50	P25656	391 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CDC5	P32562	705 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
UBX2	YML013W	YSC83	P32792	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	OAR1	P35731	278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	AVT5	P38176	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	FET3	P38993	636 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	OPT1	P40897	799 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SPG5	P42933	373 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	MRX5	P47007	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	AMA1	P50082	593 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YMD8	Q03697	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SEN15	Q04675	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	SHS1	Q07657	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TEN1	Q07921	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YOR029W	Q12243	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	AGC1	Q12482	902 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RIP1	P08067	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	REV1	P12689	985 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ZRC1	P20107	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	YCR102C	P25608	368 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CNE1	P27825	502 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
UBX2	YML013W	TMT1	P32643	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	RTC2	P38279	296 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	IDP2	P41939	412 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	KIN4	Q01919	800 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	ODC1	Q03028	310 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBX2	YML013W	CDC123	Q05791	360 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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