RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	MET30	P39014	640 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PHO90	P39535	881 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	DDI1	P40087	428 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	COG3	P40094	801 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RTS2	P40962	232 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GDS1	P41913	522 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	FMP32	P43557	207 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TOS2	P50078	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ALG13	P53178	202 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	OKP1	P53298	406 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MKC7	P53379	596 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YNL092W	P53934	400 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RSM23	Q01163	450 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PLM2	Q04383	521 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YML053C	Q04978	212 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	BCH1	Q05029	724 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RAD34	Q06665	692 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ASA1	Q06822	443 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	IZH3	Q07959	543 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	THP1	Q08231	455 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	APC9	Q12107	265 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	FCY22	Q12119	530 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
PAM18	YLR008C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ATO2	P32907	282 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SHP1	P34223	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	CHS7	P38843	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PMT6	P42934	759 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MOG1	P47123	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TIS11	P47977	285 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	UBP8	P50102	471 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GPI1	P53306	609 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NUP49	Q02199	472 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YMD8	Q03697	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MSS11	Q03825	758 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	VBA1	Q04301	562 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PRM6	Q04705	352 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	LDS2	Q08218	356 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	IRC13	Q08630	104 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	POM33	Q12164	279 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	DCN1	Q12395	269 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	FLO1	P32768	1537 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YLR462W	O13556	202 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	KIN28	P06242	306 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SKN1	P33336	771 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MSN2	P33748	704 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YKL097C	P34245	136 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ECM15	P35195	104 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YBP1	P38315	674 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YHL049C	P38722	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YHI9	P38765	294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SPL2	P38839	148 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YEL075C	P39972	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YER189W	P40104	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SYG1	P40528	902 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YFL064C	P43540	174 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	PHB2	P50085	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MIC26	P50087	233 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MMS2	P53152	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NRK1	P53915	240 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	COG5	P53951	403 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ABF2	Q02486	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YML096W	Q04489	525 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	TPO3	Q06451	622 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YNG1	Q08465	219 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HNT3	Q08702	217 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	MLH3	Q12083	715 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	LCB4	Q12246	624 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	BBP1	Q12365	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	HIS3	P06633	220 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	NMT1	P14743	455 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	POF1	P25576	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SPS18	P32572	300 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	SGE1	P33335	543 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YKL187C	P34231	750 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	ELF1	P36053	145 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PAM18	YLR008C	YBR241C	P38142	488 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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