RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	OCA5	P38738	679 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NSG1	P38837	291 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YJL193W	P39542	402 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YIL086C	P40503	102 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SYG1	P40528	902 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MNN5	P46982	586 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YLR460C	P54007	376 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	COA4	Q05809	96 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PHO92	Q06390	306 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SSK1	Q07084	712 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	BSC6	Q08280	497 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	BAG7	Q12128	409 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SKM1	Q12469	655 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	COX9	P07255	59 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PET122	P10355	254 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PEX32	P38292	413 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MSS4	P38994	779 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PEX7	P39108	375 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YIL152W	P40455	235 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HXT9	P40885	567 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SHR5	P41912	237 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PMT6	P42934	759 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPE1	P46969	238 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YJR120W	P47157	116 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YGR067C	P53243	804 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HXT11	P54862	567 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	EKI1	Q03764	534 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HLR1	Q04429	423 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	COQ10	Q08058	207 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HRT1	Q08273	121 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ENB1	Q08299	606 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RDR1	Q08904	546 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ATG41	Q12048	136 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	THI4	P32318	326 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TRS65	P32893	560 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MSN4	P33749	630 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SFK1	P35735	353 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MRPL3	P36516	390 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPP1	P38786	293 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YHR180W	P38868	163 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	AIM25	P47140	327 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SCS7	Q03529	384 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SSY1	Q03770	852 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YMR130W	Q04223	302 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	BTS1	Q12051	335 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	REX3	Q12090	404 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MCP1	Q12106	302 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CPR2	P23285	205 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YCR102C	P25608	368 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CWH43	P25618	953 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	TAF14	P35189	244 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YER184C	P39961	794 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	BNA6	P43619	295 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	MRPS16	Q02608	121 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PEX30	Q06169	523 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ASR1	Q06834	288 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ENV7	Q12003	364 aa		5.89	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CDC34	P14682	295 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	STF2	P16965	84 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YCR006C	P25350	157 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	ATS1	P31386	333 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.88	□□□□□ -1.47	not detected
MIA40	YKL195W	SPT10	P35208	640 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PTC7	P38797	343 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	YIL067C	P40514	678 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	PKP1	P40530	394 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CAT5	P41735	233 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	POP1	P41812	875 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	SNO3	P43544	222 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	CCC1	P47818	322 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIA40	YKL195W	BRR6	P53062	197 aa		5.88	□□□□□ -1.47

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