RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	FMP52	P40008	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	QDR1	P40475	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PLB2	Q03674	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YML096W	Q04489	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	HOF1	Q05080	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MET3	P08536	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MKK2	P32491	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YBR285W	P38354	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MAL12	P53341	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RNH202	Q05635	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MRPL4	P36517	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	STS1	P38637	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NSG1	P38837	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	AIM46	P38885	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BAP3	P41815	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	AVT4	P50944	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YNR014W	P53719	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GLO2	Q05584	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PPH21	P23594	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RHB1	P25378	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YMC1	P32331	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MKK1	P32490	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SMK1	P41808	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BUL1	P48524	976 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FIT1	Q04433	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SPC3	Q12133	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
YOR1	YGR281W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	EMC5	P40540	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GNP1	P48813	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BSC5	P53755	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VBA1	Q04301	562 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SCP1	Q08873	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YPR096C	O13587	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PUP1	P25043	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CLB6	P32943	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MSN4	P33749	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ECM15	P35195	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SKN7	P38889	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PGD1	P40356	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YIL029C	P40538	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	AZF1	P41696	914 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SPG5	P42933	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	COX16	P47081	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VHT1	P53241	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MIX14	Q04341	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BDS1	Q08347	646 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	UBA3	Q99344	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	COX9	P07255	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	UTR1	P21373	530 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ACB1	P31787	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YEF1	P32622	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	MEP3	P53390	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	HXT15	P54854	567 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ATG21	Q02887	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YOR1	YGR281W	SRO77	P38163	1010 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PRE3	P38624	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CAF16	P43569	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	NPY1	P53164	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	YNR066C	P53752	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	AAH1	P53909	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	FYV6	P53913	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ISU1	Q03020	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RTN2	Q12443	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	TUL1	P36096	758 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CAF40	P53829	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	GPI15	P53961	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	CWC27	Q02770	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	PHO5	P00635	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ARG80	P07249	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	SEC59	P20048	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YOR1	YGR281W	ALY1	P36117	915 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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