RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MIC26	P50087	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SWS2	P53937	143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PRM6	Q04705	352 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ATG17	Q06410	417 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RSA1	Q08932	381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	GPM2	Q12008	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PAN1	P32521	1480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ATR1	P13090	542 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ERD1	P16151	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SNF6	P18888	332 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CKA2	P19454	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PMT2	P31382	759 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	AST1	P35183	429 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YFR057W	P43625	151 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	GOR1	P53839	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	FCY22	Q12119	530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PER33	Q12144	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	AYT1	Q12226	474 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	BNR1	P40450	1375 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPO31	P04051	1460 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CTA1	P15202	515 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	DEP1	P31385	405 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	JEN1	P36035	616 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YKL075C	P36083	450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	NAT2	P37293	288 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YPS5	P53057	165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YGR067C	P53243	804 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RTC4	P53850	401 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	IBD2	P53892	351 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ASI3	P53983	676 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PEX30	Q06169	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	DSE3	Q08729	430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	DCN1	Q12395	269 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	EAF3	Q12432	401 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YAK1	P14680	807 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CMK2	P22517	447 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CUE1	P38428	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RCK1	P38622	512 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	NDT80	P38830	627 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SUR2	P38992	349 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SHC1	P39000	512 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SER33	P40510	469 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPR2	P40571	144 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	NBP35	P52920	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	DPP1	Q05521	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	LOA1	Q06508	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	VIK1	Q12045	647 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	INO2	P26798	304 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YBR062C	P38239	180 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YBP1	P38315	674 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	HEM14	P40012	539 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YIL029C	P40538	142 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YGL159W	P53110	370 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ALG13	P53178	202 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	TPC1	P53257	314 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YIP3	P53633	176 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	FAR10	Q06001	478 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	JLP1	Q12358	412 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	STH1	P32597	1359 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CHL4	P38907	458 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPH1	P39956	796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	VAB2	P40003	282 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	POG1	P40473	351 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	AIM23	P47015	356 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	GMC1	Q04399	608 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PEX10	Q05568	337 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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