RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	JLP1	Q12358	412 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PUT2	P07275	575 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	CLB3	P24870	427 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	THI4	P32318	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SPT10	P35208	640 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	GPX1	P36014	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ECM8	P38246	354 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TSC10	P38342	320 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
YNL296W	YNL296W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RSC9	Q03124	581 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SHE9	Q04172	456 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	BTS1	Q12051	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RLM1	Q12224	676 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TIM9	O74700	87 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	HSP30	P25619	332 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DPB3	P27344	201 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	BIG1	P38813	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YAR028W	P39548	234 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RBG1	P39729	369 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	KRE29	P40026	464 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	AGE2	P40529	298 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	IMA5	P40884	581 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	NIT3	P49954	291 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TWF1	P53250	332 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YNR064C	P53750	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	COQ10	Q08058	207 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	IZH2	Q12442	317 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RTN2	Q12443	393 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SAS5	Q99314	248 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	MER1	P16523	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RPD3	P32561	433 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YBL029W	P38201	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	FIG1	P38224	298 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RCK1	P38622	512 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RPP1	P38786	293 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PSD1	P39006	500 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YIP5	P53108	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YGR045C	P53229	120 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TVP15	Q03860	143 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	KRE28	Q04431	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TPO3	Q06451	622 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DCI1	Q08558	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	FCY22	Q12119	530 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RAP1	P11938	827 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SED4	P25365	1065 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SNC1	P31109	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DEP1	P31385	405 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TRS65	P32893	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	URB2	P47108	1174 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TOS2	P50078	622 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	MAL13	P53338	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YML119W	Q03208	357 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	FMN1	Q03778	218 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	IRC25	Q07951	179 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DFG16	Q99234	619 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ARG3	P05150	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	PDE2	P06776	526 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	MIG1	P27705	504 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	MDL1	P33310	695 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YPT53	P36019	220 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	OAF3	P36023	863 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YBR096W	P38256	230 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YIL166C	P40445	542 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	TAX4	P47030	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	MDE1	P47095	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	TNA1	P53322	534 aa		4.15	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.6 ms