RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TEL1	P38110	2787 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TPK3	P05986	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TFS1	P14306	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YCR102C	P25608	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	LYP1	P32487	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YKR015C	P36111	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YBR138C	P38277	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YLF2	P38746	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YJL193W	P39542	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RRG9	P40156	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SOK1	P40317	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YFR054C	P43622	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CHA4	P43634	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	EXG2	P52911	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	COS1	P53822	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YMD8	Q03697	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	EKI1	Q03764	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SPR28	Q04921	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SYO1	Q07395	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SPC3	Q12133	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
APJ1	YNL077W	APC2	Q12440	853 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ERD1	P16151	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SNF6	P18888	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CLB2	P24869	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SNC1	P31109	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	TIM12	P32830	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MDL1	P33310	695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MOH1	P38191	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
APJ1	YNL077W	VMA22	P38784	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YIL166C	P40445	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PKP1	P40530	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SWP82	P43554	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YGL235W	P53071	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PFA5	Q03289	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ENB1	Q08299	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MCP1	Q12106	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MDM32	Q12171	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SCM3	Q12334	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	REP1	P03871	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	GCN3	P14741	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YPK2	P18961	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	CNA1	P23287	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RPC34	P32910	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HXT9	P40885	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	MSS2	P40990	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	QRI7	P43122	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RPE1	P46969	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SLD3	P53135	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YNR062C	P53748	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HXT11	P54862	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	GRX5	Q02784	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	UIP4	Q08926	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HIS3	P06633	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	PRP28	P23394	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	HSP30	P25619	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	OAC1	P32332	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	JEN1	P36035	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RTC2	P38279	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YBR242W	P38331	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	YHR180W	P38868	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	ECO1	P43605	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APJ1	YNL077W	IDS2	P46958	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.8 ms