RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR196W	YMR196W	MET2	P08465	486 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CBS2	P14905	389 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	BUB3	P26449	341 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	LAC1	P28496	418 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
YMR196W	YMR196W	MKK1	P32490	508 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YAR028W	P39548	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	FAU1	P40099	211 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PAC10	P48363	199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	ROG1	P53118	685 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YGR079W	P53249	370 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	TRM82	Q03774	444 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	AVT6	P40074	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	COG3	P40094	801 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PRM8	P53174	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YML096W	Q04489	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CTS2	Q06350	511 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	GLO4	Q12320	285 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	TSC13	Q99190	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CDC34	P14682	295 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	ATG22	P25568	528 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SIP1	P32578	815 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	KAP122	P32767	1081 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YHR112C	P38716	378 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PTC7	P38797	343 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
YMR196W	YMR196W	CEM1	P39525	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SPO73	P40031	143 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CIS3	P47001	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	STE24	P47154	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	BUD17	P53727	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	BSC1	Q12140	328 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	AGC1	Q12482	902 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SLY41	P22215	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	HCM1	P25364	564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	NTH1	P32356	751 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SKN1	P33336	771 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	DOA1	P36037	715 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	NVJ1	P38881	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YER121W	P40076	114 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PAC11	P40960	533 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	BIT61	P47041	543 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PKP2	P53170	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	RHO4	Q00246	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SED5	Q01590	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YSA1	Q01976	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	XYL2	Q07993	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CSM4	Q08955	156 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	VCX1	Q99385	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
YMR196W	YMR196W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	HXT2	P23585	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PRE4	P30657	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	TUL1	P36096	758 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	ICS2	P38284	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	ELO1	P39540	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YGR201C	P42936	225 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CDH1	P53197	566 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CRR1	Q05790	422 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	DCI1	Q08558	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	VPS33	P20795	691 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MKK2	P32491	506 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	BET3	P36149	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	GIP2	P40036	548 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YKE4	P40544	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MET28	P40573	187 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	SMK1	P41808	388 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	UFD1	P53044	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YNR014W	P53719	212 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	COG5	P53951	403 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	YAT1	P80235	687 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	APC4	Q04601	652 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR196W	YMR196W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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