RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A HIF1Q12373 385 aa2.88□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YDL012CQ12489 107 aa2.88□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A TY3A-IQ99219 290 aa2.88□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A DDP1Q99321 188 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A POX1P13711 748 aa2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A ECT1P33412 323 aa2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SIP3P38717 1229 aa2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SMP3Q04174 516 aa2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YPQ1Q12010 308 aa2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.87□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A UNG1P12887 359 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A HMX1P32339 317 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A TVP38P36164 337 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SIF2P38262 535 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RSM25P40496 264 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A FIS1P40515 155 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YJR030CP47101 745 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A EFM3P47163 339 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A LST7P53237 242 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RTC4P53850 401 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A MCH1Q07376 486 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YOR376WQ08900 122 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A UBA3Q99344 299 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A VPS13Q07878 3144 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A UBR2Q07963 1872 aa2.86□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A STE3P06783 470 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A CKI1P20485 582 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SAG1P20840 650 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A PMT2P31382 759 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RPC25P35718 212 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YKT6P36015 200 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A COS9P36034 407 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A UIP5P36137 443 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YHR122WP38829 231 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A ATG7P38862 630 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A PEX22P39718 180 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A AIM23P47015 356 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A BIO3P50277 480 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A AQR1P53943 586 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A ECM11Q04110 302 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YDR115WQ04598 105 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A GLE1Q12315 538 aa2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RIF1P29539 1916 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A MRPS5P33759 307 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YET1P35723 206 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YBR241CP38142 488 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SHE1P38200 338 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A CHL4P38907 458 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SPT8P38915 602 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A TVP23P38962 199 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RBG1P39729 369 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YHC3P47040 408 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YJR054WP47114 497 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A CDH1P53197 566 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YGR015CP53208 328 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A RNH201P53942 307 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A SLT2Q00772 484 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A FUS2Q05670 677 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A GAS2Q06135 555 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A LDB17Q12342 491 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A YDR524C-BQ3E6R4 66 aa2.84□□□□□ -1.95
YLR347W-AYLR347W-A LAA1P39526 2014 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A ASP3-2P0CX77 362 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A ASP3-3P0CX78 362 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A ASP3-4P0CX79 362 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A ASP3-1P0CZ17 362 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A CKA2P19454 339 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A YEL043WP32618 956 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A PDC2P32896 925 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A IST2P38250 946 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A PRM1P53835 661 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A YNL146WP53906 100 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A TRM82Q03774 444 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A NAT4Q04751 285 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A IES4Q08561 116 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A APC5Q08683 685 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A FRE8Q12209 686 aa2.83□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A TPI1P00942 248 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A RPL4AP10664 362 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A TCP1P12612 559 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A TAL1P15019 335 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YLR347W-AYLR347W-A OM45P16547 393 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64 ms