RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W INO2P26798 304 aa3.12□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W YMR262WP38430 313 aa3.12□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W YIL059CP40520 121 aa3.12□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W NAS2P40555 220 aa3.12□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W VPH2P32341 215 aa3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W ZRT3P34240 503 aa3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W INA22P40576 216 aa3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W SHE4P51534 789 aa3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W DIA1P54005 336 aa3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W CSI1Q04368 295 aa3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W RPB9P27999 122 aa3.1□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W SMI1P32566 505 aa3.1□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W CSE1P33307 960 aa3.1□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W FMP48P53233 369 aa3.1□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W MGR3Q04472 501 aa3.1□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W MED8P38304 223 aa3.09□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W CAJ1P39101 391 aa3.09□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W YMR244WQ04018 355 aa3.09□□□□□ -1.91
YLL047WYLL047W SSN2P38931 1420 aa3.09□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W GAL3P13045 520 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W MSS116P15424 664 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W DSE1P40077 573 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YFL040WP43562 540 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YJL144WP47009 104 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YGL118CP53132 145 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W BUR2Q05949 395 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W MIM1Q08176 113 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W TFC7Q12415 435 aa3.08□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YPR096CO13587 100 aa3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YHR035WP38769 630 aa3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ECM14P38836 430 aa3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YPL264CQ08980 353 aa3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W VIK1Q12045 647 aa3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W INO80P53115 1489 aa3.07□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W DAL5P15365 543 aa3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W UTP25P40498 721 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ASG7P46993 209 aa3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W HSH155P49955 971 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W CAX4P53223 239 aa3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YNR066CP53752 436 aa3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W PGC1Q08959 321 aa3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ERP3Q12403 225 aa3.06□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W PES4P39684 611 aa3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YGR168CP53293 376 aa3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W OKP1P53298 406 aa3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W IRC4Q03036 179 aa3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W STE23Q06010 1027 aa3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YPR063CQ12160 140 aa3.05□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W RPS23BP0CX30 145 aa3.04□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W IFM1P25038 676 aa3.04□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W PET18P25362 215 aa3.04□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W LIF1P53150 421 aa3.04□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W HRT1Q08273 121 aa3.04□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W SPS100P13130 326 aa3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ARO4P32449 370 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W AIM29P36154 155 aa3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W PET8P38921 284 aa3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W YDR222WQ04925 415 aa3.03□□□□□ -1.92
YLL047WYLL047W ERD1P16151 362 aa3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W YHL044WP38727 235 aa3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W YFR045WP43617 309 aa3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W SNX41Q04053 625 aa3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W VPS20Q04272 221 aa3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.01□□□□□ -1.93not detected
YLL047WYLL047W YPS1P32329 569 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W SUR1P33300 382 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W TKL2P33315 681 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W MCH2P36032 473 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W SDH4P37298 181 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W SSO2P39926 295 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W UFD1P53044 361 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W GTO3Q04806 366 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W YDR286CQ05530 114 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W YLR446WQ06204 433 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W LAG2Q92325 660 aa3.01□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W DAL81P21657 970 aa3□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W YKL162CP36052 402 aa3□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YLL047WYLL047W LOH1P47055 219 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms