RNA–Protein interactions for RNA: YJR138W

IML1, Transcript of GTPase-activating protein (GAP), subunit of SEA and Iml1p complexes, yeast

Gene IML1, Length 4,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IML1	YJR138W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	NPL6	P32832	435 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	VMA11	P32842	164 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	JEN1	P36035	616 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	BUD8	P41698	603 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YGR201C	P42936	225 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YGL176C	P46945	554 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TY4A-J	P47023	414 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ALY2	P47029	1046 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YJR154W	P47181	346 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CCC1	P47818	322 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YDL186W	P48568	277 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TPC1	P53257	314 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	HOT1	Q03213	719 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TLG1	Q03322	224 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SGT1	Q08446	395 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	BBP1	Q12365	385 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	HYM1	P32464	399 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YKL075C	P36083	450 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YHR177W	P38867	453 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	STB1	P42845	420 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	URB2	P47108	1174 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TWF1	P53250	332 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CRZ1	P53968	678 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YKR005C	Q02203	525 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RSC9	Q03124	581 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YMR209C	Q03648	457 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	NTO1	Q12311	748 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RTR2	Q12378	196 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ZRT2	Q12436	422 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MRX4	Q12467	430 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	KIN28	P06242	306 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	PDC2	P32896	925 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CPR5	P35176	225 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	NUP120	P35729	1037 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YHR035W	P38769	630 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MTC6	P38849	526 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YHR219W	P38900	624 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ECM1	P39715	212 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RBG1	P39729	369 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ARG5,6	Q01217	863 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SPR28	Q04921	423 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	COX20	Q04935	205 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YOR238W	Q08634	303 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YPR015C	Q12531	247 aa		1.03	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	EXO70	P19658	623 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	MDH2	P22133	377 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	VMA3	P25515	160 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	NUP2	P32499	720 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	MTC7	P32633	139 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.03	□□□□□ -2.25	not detected
IML1	YJR138W	PTC7	P38797	343 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	YER084W	P40057	128 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	YJL055W	P47044	245 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	MTL1	P53214	551 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	IMO32	P53219	342 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RNT1	Q02555	471 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	AIM36	Q03798	255 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	PEX12	Q04370	399 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	UPS1	Q05776	175 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	UBX3	Q12229	455 aa		1.03	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RAD7	P06779	565 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	PTC6	P25646	442 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	ACH1	P32316	526 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	PTH2	P34222	208 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.02	□□□□□ -2.25	not detected
IML1	YJR138W	YGR126W	P53274	230 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	YMR155W	Q03795	547 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	SCW10	Q04951	389 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	FRA1	Q07825	749 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	GRC3	Q07845	632 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	YPL247C	Q12523	523 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	TSC13	Q99190	310 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	TOM1	Q03280	3268 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	MSW1	P04803	379 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	STE14	P32584	239 aa		1.02	□□□□□ -2.25
IML1	YJR138W	OAF3	P36023	863 aa		1.02	□□□□□ -2.25

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