RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q DET1Q99288 334 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data0.96□□□□□ -2.26not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL043WP32618 956 aa0.96□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q ZIM17P42844 174 aa0.96□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP48P53233 369 aa0.96□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q SYF2P53277 215 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM10Q12400 293 aa0.96□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFC7Q12415 435 aa0.96□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL163WP0CF20 169 aa0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO80P20052 293 aa0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAB3P36076 571 aa0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q MNL1P38888 796 aa0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q LCP5P40079 357 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q RET3P53600 189 aa0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q RMT2Q03305 412 aa0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPN5Q12250 445 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAP2P18962 818 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAR1P21268 830 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRP72P38688 640 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR177WP38867 453 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q POP2P39008 433 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q LST7P53237 242 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q AQR1P53943 586 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q MEH1Q02205 184 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPH1Q06160 661 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL075CQ08234 1294 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAF10Q12030 206 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY3A-GQ12173 290 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY3A-IQ99219 290 aa0.94□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q NRG2P38082 220 aa0.93□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBL028CP38202 106 aa0.93□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPP381P38282 291 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data0.93□□□□□ -2.26not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q SDS23P53172 527 aa0.93□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACT1P60010 375 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERP3Q12403 225 aa0.93□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q INH1P01097 85 aa0.92□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPC53P25441 422 aa0.92□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data0.92□□□□□ -2.26not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q CIK1Q01649 594 aa0.92□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBX2Q04228 584 aa0.92□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSK1P32048 576 aa0.91□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPN12P32496 274 aa0.91□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q EPL1P43572 832 aa0.91□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q LSG1P53145 640 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM22Q12328 207 aa0.91□□□□□ -2.26
tW(UCA)QtW(UCA)Q JNM1P36224 373 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q EDC2P40023 145 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q DSE1P40077 573 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q LCB2P40970 561 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q PMT4P46971 762 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q UFD1P53044 361 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS68Q12016 184 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPN6Q12377 434 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q ISA2Q12425 185 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q MHP1P43638 1398 aa0.9□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAK1P14680 807 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARF2P19146 181 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPH2P32341 215 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHL044WP38727 235 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q MLH1P38920 769 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPC19Q03954 165 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR078CQ06813 372 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRM4Q12498 284 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q FSH3Q99369 266 aa0.89□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL26AP05743 127 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCO1P23833 295 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRT12P25381 491 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG9P29704 444 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER188WP40103 239 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q DSK2P48510 373 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL26BP53221 127 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPC1P53257 314 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q SMP3Q04174 516 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q CSM3Q04659 317 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q DTD1Q07648 150 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPM3Q12326 303 aa0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFS1P14306 219 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS1P21576 704 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBR1P24309 405 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUD2P33314 1104 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q KTI12P34253 313 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPE1P35728 441 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q PES4P39684 611 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPS2P53159 387 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX27Q08580 376 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q APC5Q08683 685 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR012WQ12351 137 aa0.87□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q CBP2P03874 630 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q ZWF1P11412 505 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRE7P23724 241 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
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