RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	YNL046W	P53956	172 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	SCS7	Q03529	384 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	GMC1	Q04399	608 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	DAL4	Q04895	635 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	WHI5	Q12416	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	MRP13	P12686	339 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	TOP3	P13099	656 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	CLB6	P32943	380 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	HXT9	P40885	567 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	PTR3	P43606	678 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	COS6	P53344	381 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	HXT11	P54862	567 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	HNM1	P19807	563 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YEL043W	P32618	956 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	ROT2	P38138	954 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	LNP1	P38878	278 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	PET191	Q02772	108 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	MMT1	Q03218	510 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	VPS60	Q03390	229 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	SNA4	Q07549	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	NTG2	Q08214	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	MUM3	Q08750	479 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	FIT3	Q08907	204 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	SPE4	Q12455	300 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL296W	YNL296W	CDC8	P00572	216 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SEC12	P11655	471 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ERG4	P25340	473 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	MCM10	P32354	571 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	NNK1	P36003	928 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	FRE2	P36033	711 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ECM34	P38728	170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SNF12	P53628	566 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SNF8	Q12483	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YAK1	P14680	807 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PHO81	P17442	1178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ERD2	P18414	219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	CNA1	P23287	553 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	GIT1	P25346	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	RAD14	P28519	371 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	STE14	P32584	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	CLG1	P35190	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	VPS41	P38959	992 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PIC2	P40035	300 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	LAS21	P40367	830 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	GAB1	P41733	394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	ARV1	Q06541	321 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	GAT3	Q07928	141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL296W	YNL296W	SRL1	Q08673	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms