RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	FAU1	P40099	211 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MPM1	P40364	252 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YIL086C	P40503	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MET28	P40573	187 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	IBA57	P47158	497 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YDL183C	P48569	320 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	NUP57	P48837	541 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SRL4	Q03085	281 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SPC19	Q03954	165 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	KRE28	Q04431	385 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RNH1	Q04740	348 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ORM2	Q06144	216 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ARR3	Q06598	404 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	LOT6	Q07923	191 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	BSC6	Q08280	497 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MED11	Q99278	115 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TPK3	P05986	398 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NTG1	P31378	399 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MKK1	P32490	508 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YKR015C	P36111	568 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	FMP23	P38231	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TDA11	P38854	504 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	AIM2	P39721	246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	BUR6	P40096	142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ICE2	P40499	491 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	AZF1	P41696	914 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PMT4	P46971	762 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ATP23	P53722	227 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MMT2	Q08970	484 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TGS1	Q12052	315 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	FRE7	Q12333	620 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RKM5	Q12367	367 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YOS9	Q99220	542 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	VCX1	Q99385	411 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	CWH43	P25618	953 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PMT2	P31382	759 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ECM8	P38246	354 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YBR285W	P38354	144 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	VPS52	P39904	641 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SLD3	P53135	668 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PRM8	P53174	237 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YGR079W	P53249	370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PLM2	Q04383	521 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	HNT3	Q08702	217 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	BSC1	Q12140	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GLE1	Q12315	538 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
CPR4	YCR069W	GAL4	P04386	881 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RER1	P25560	188 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	UBC8	P28263	218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
CPR4	YCR069W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RPC34	P32910	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ECM15	P35195	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	UTH1	P36135	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	EXO84	P38261	753 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	UME6	P39001	836 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DDI1	P40087	428 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	VRG4	P40107	337 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YPS6	P40583	537 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YGL101W	P53144	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YLR460C	P54007	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TLG1	Q03322	224 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GRX3	Q03835	250 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ARP10	Q04549	284 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	MLC2	Q06580	163 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	TRM10	Q12400	293 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	SEC12	P11655	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	DAL82	P21705	255 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	CNA1	P23287	553 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	YIM1	P28625	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	PTP2	P29461	750 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CPR4	YCR069W	ARN2	P38724	620 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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