RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	FZO1	P38297	855 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SRP14	P38985	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	FAA2	P39518	744 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	DDI1	P40087	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YIR016W	P40572	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	HOC1	P47124	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	TOS2	P50078	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PCP1	P53259	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YIP3	P53633	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CAC2	Q04199	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PEX10	Q05568	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	NDE2	Q07500	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PLB3	Q08108	686 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YAP7	Q08182	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	APC9	Q12107	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SUC2	P00724	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ZRT1	P32804	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SSO1	P32867	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	LAG1	P38703	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ATG7	P38862	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	HAT2	P39984	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YER121W	P40076	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	SOK1	P40317	901 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	POG1	P40473	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YIL060W	P40519	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RTT101	P47050	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	TAD2	P47058	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ORC5	P50874	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	VEL1	P53058	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CPD1	P53314	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ASR1	Q06834	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	POM33	Q12164	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	NAM9	P27929	486 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ITR2	P30606	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YOX1	P34161	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	IST2	P38250	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RBG1	P39729	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CFD1	P40558	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CDC1	P40986	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YJR149W	P47177	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	LST7	P53237	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CTF19	Q02732	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ALE1	Q08548	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	FAR1	P21268	830 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	TOA2	P32774	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	ATO2	P32907	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MRX3	P38172	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	IKI1	P38874	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	FLO5	P38894	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
ECM1	YAL059W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	VAB2	P40003	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	FAU1	P40099	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	AGE2	P40529	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YKE4	P40544	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	GPI1	P53306	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MSS11	Q03825	758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	CSM4	Q08955	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YOP1	Q12402	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ECM1	YAL059W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	NAM2	P11325	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	DCC1	P25559	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	MRPL6	P32904	214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	CSE1	P33307	960 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	RIM2	P38127	377 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	RCK2	P38623	610 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	FRT2	P39734	528 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	ICE2	P40499	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	PCI8	P40512	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	CAF40	P53829	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	ASI1	P54074	624 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	IRC4	Q03036	179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	JLP1	Q12358	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	RKM5	Q12367	367 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	ORT1	Q12375	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	GIT1	P25346	518 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ECM1	YAL059W	MKK1	P32490	508 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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