RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPS6KA5O75582 802 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGBP02675 491 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAPK7Q13164 816 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DAW1Q8N136 415 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FSIP1Q8NA03 581 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF149Q8NC42 400 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLD4Q9HCU8 107 aa26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACTN1P12814 892 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CD52P31358 61 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POU5F1BQ06416 359 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAK2Q13177 524 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ODR4Q5SWX8 454 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BSNDQ8WZ55 320 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APBB2Q92870 758 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRO3102Q9H379 93 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.56■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PHKA2P46019 1235 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP2R5AQ15172 486 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCTN1Q2MV58 587 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM228AQ86W67 206 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IFT74Q96LB3 600 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 REEP2Q9BRK0 252 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNMDQ9H2S6 317 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PADI3Q9ULW8 664 aa26.55■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPR182O15218 404 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NAMPTP43490 491 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NDUFA8P51970 172 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTENP60484 403 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYMKA6NI61 221 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BAIAP3O94812 1187 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYKP43405 635 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GIT2Q14161 759 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SHHQ15465 462 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HERVK_113Q902F9 699 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C17orf75Q9HAS0 396 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP25Q9UHP3 1055 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.53■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IKBKEQ14164 716 aa26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX12PQ92771 950 aa26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.52■■□□□ 1.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EFCAB14O75071 495 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLS3P13797 630 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGFR4P22455 802 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PEX3P56589 373 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AMPD3Q01432 767 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DYMQ7RTS9 669 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TDHQ8IZJ6 230 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DEPTORQ8TB45 409 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.51■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SFI1A8K8P3 1242 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM13AO94988 1023 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLFN14P0C7P3 912 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF131P52739 623 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RASIP1Q5U651 963 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STAMQ92783 540 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.5■■□□□ 1.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms