Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
IKBKEQ14164 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IKBKEQ14164 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IKBKEQ14164 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
IKBKEQ14164 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
IKBKEQ14164 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IKBKEQ14164 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
IKBKEQ14164 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
IKBKEQ14164 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IKBKEQ14164 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
IKBKEQ14164 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
IKBKEQ14164 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
IKBKEQ14164 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
IKBKEQ14164 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
IKBKEQ14164 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IKBKEQ14164 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IKBKEQ14164 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IKBKEQ14164 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IKBKEQ14164 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
IKBKEQ14164 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IKBKEQ14164 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IKBKEQ14164 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IKBKEQ14164 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
IKBKEQ14164 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IKBKEQ14164 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
IKBKEQ14164 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
IKBKEQ14164 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IKBKEQ14164 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IKBKEQ14164 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IKBKEQ14164 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IKBKEQ14164 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
IKBKEQ14164 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
IKBKEQ14164 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
IKBKEQ14164 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
IKBKEQ14164 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IKBKEQ14164 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IKBKEQ14164 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IKBKEQ14164 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
IKBKEQ14164 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IKBKEQ14164 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IKBKEQ14164 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IKBKEQ14164 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IKBKEQ14164 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IKBKEQ14164 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IKBKEQ14164 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IKBKEQ14164 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IKBKEQ14164 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
IKBKEQ14164 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
IKBKEQ14164 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
IKBKEQ14164 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IKBKEQ14164 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IKBKEQ14164 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IKBKEQ14164 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
IKBKEQ14164 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IKBKEQ14164 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IKBKEQ14164 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
IKBKEQ14164 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
IKBKEQ14164 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
IKBKEQ14164 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
IKBKEQ14164 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IKBKEQ14164 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IKBKEQ14164 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IKBKEQ14164 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IKBKEQ14164 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IKBKEQ14164 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IKBKEQ14164 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IKBKEQ14164 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
IKBKEQ14164 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IKBKEQ14164 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IKBKEQ14164 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
IKBKEQ14164 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IKBKEQ14164 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
IKBKEQ14164 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
IKBKEQ14164 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
IKBKEQ14164 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IKBKEQ14164 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IKBKEQ14164 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IKBKEQ14164 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IKBKEQ14164 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IKBKEQ14164 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IKBKEQ14164 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IKBKEQ14164 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
IKBKEQ14164 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IKBKEQ14164 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IKBKEQ14164 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IKBKEQ14164 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IKBKEQ14164 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IKBKEQ14164 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IKBKEQ14164 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IKBKEQ14164 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IKBKEQ14164 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IKBKEQ14164 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IKBKEQ14164 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
IKBKEQ14164 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IKBKEQ14164 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IKBKEQ14164 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
IKBKEQ14164 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IKBKEQ14164 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IKBKEQ14164 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IKBKEQ14164 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
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