RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	VRP1	P37370	817 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	YPR109W	Q06104	294 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	PDR1	P12383	1068 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	BUD3	P25558	1636 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	ITT1	Q04638	464 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	YPR015C	Q12531	247 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	DOP1	Q03921	1698 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	XDJ1	P39102	459 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PPQ1	YPL179W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	AIM7	Q12156	149 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	CAT8	P39113	1433 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	DRS2	P39524	1355 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	NUD1	P32336	851 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	TEA1	P47988	759 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	STR2	P47164	639 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	GLC3	P32775	704 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	ISM1	P48526	1002 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	ATF2	P53296	535 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	SAS4	Q04003	481 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	MMS1	Q06211	1407 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	NPL4	P33755	580 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	SIT4	P20604	311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	YSP2	Q06681	1438 aa		5.71	□□□□□ -1.49
PPQ1	YPL179W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	RTF1	P53064	558 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	DNF2	Q12675	1612 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	SSM4	P40318	1319 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	NIS1	P53939	407 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TRM3	Q07527	1436 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	GYP1	Q08484	637 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	SEC2	P17065	759 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	YNL115C	P53925	644 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	SRB8	P25648	1427 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	HST2	P53686	357 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	FPK1	P53739	893 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	KEX2	P13134	814 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPQ1	YPL179W	KIN1	P13185	1064 aa		5.65	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	LEO1	P38439	464 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	ERF2	Q06551	359 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	BNR1	P40450	1375 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	SDH2	P21801	266 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	AGE1	Q04412	482 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	VMR1	P38735	1592 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	MMP1	Q12372	583 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PPQ1	YPL179W	RRN7	P40992	514 aa		5.59	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.59	□□□□□ -1.52	not detected
PPQ1	YPL179W	CSN12	P47130	423 aa		5.59	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	TUB4	P53378	473 aa		5.59	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	SLY41	P22215	453 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	AMS1	P22855	1083 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	GCN2	P15442	1659 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	ERG12	P07277	443 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	SCJ1	P25303	377 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	PUS6	P53294	404 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	DNF3	Q12674	1656 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	MOD5	P07884	428 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	TPD3	P31383	635 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	LAM6	Q08001	693 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	RAS1	P01119	309 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	ESS1	P22696	170 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PPQ1	YPL179W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52

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