RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	FIG4	P42837	879 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	GAL2	P13181	574 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	SEC2	P17065	759 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	ISF1	P32488	338 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	IXR1	P33417	597 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	ECM23	Q02710	187 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	PUP1	P25043	261 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	PHO87	P25360	923 aa		3.23	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	PEP12	P32854	288 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	SOH1	P38633	127 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	CWH41	P53008	833 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	VAC17	P25591	423 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	UBX7	P38349	436 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TBS1	P38114	1094 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	GAS4	Q08271	471 aa		3.22	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	VAN1	P23642	535 aa		3.21	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	TRS33	Q99394	268 aa		3.21	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	YPR015C	Q12531	247 aa		3.21	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	TSC13	Q99190	310 aa		3.21	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	VRP1	P37370	817 aa		3.2	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	RTT106	P40161	455 aa		3.2	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	ATG20	Q07528	640 aa		3.2	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	YDR344C	Q05510	147 aa		3.2	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	HAT1	Q12341	374 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	SEC20	P28791	383 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	RRN6	P32786	894 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	YML083C	Q04526	418 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	ASF1	P32447	279 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	BCK2	P33306	851 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	KAR5	Q04746	504 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	YPR084W	Q06821	456 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	PUN1	Q06991	263 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	MOD5	P07884	428 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	MIP1	P15801	1254 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	UTR2	P32623	467 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	MKS1	P34072	584 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	HEM3	P28789	327 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	SRS2	P12954	1174 aa		3.17	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	APL6	P46682	809 aa		3.17	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
STB4	YMR019W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	BDP1	P46678	594 aa		3.16	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	NTH2	P35172	780 aa		3.16	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	HDA3	Q06623	655 aa		3.16	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	BDS1	Q08347	646 aa		3.16	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	CYT1	P07143	309 aa		3.15	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	FBP26	P32604	452 aa		3.15	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	ISU1	Q03020	165 aa		3.15	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	PNP1	Q05788	311 aa		3.15	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	PUS5	Q06244	254 aa		3.15	□□□□□ -1.9
STB4	YMR019W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	XDJ1	P39102	459 aa		3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	APP1	P53933	587 aa		3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	HED1	Q03937	162 aa		3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.15	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ROM1	P53046	1155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	AMS1	P22855	1083 aa		3.14	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	SPR3	P41901	512 aa		3.14	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	HST3	P53687	447 aa		3.14	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	UBP1	P25037	809 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	YBR287W	P38355	427 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	UGA3	P26370	528 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91

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