RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
TRZ1	YKR079C	PRE3	P38624	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	RRN7	P40992	514 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	FIG4	P42837	879 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	EMP47	P43555	445 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	YML083C	Q04526	418 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	ENV9	Q08651	330 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	BMT6	Q12291	365 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	TPD3	P31383	635 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	ISF1	P32488	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	SLD2	P34252	453 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	GAL2	P13181	574 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	KTR7	P40504	517 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	HXT10	P43581	546 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	SAS4	Q04003	481 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	ECM23	Q02710	187 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	APL6	P46682	809 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	YJL171C	P46992	396 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	PHO87	P25360	923 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	VAC17	P25591	423 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	HAP4	P14064	554 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	UBX7	P38349	436 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	SOH1	P38633	127 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	GYP1	Q08484	637 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRZ1	YKR079C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	MOD5	P07884	428 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	HAT1	Q12341	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	GAS4	Q08271	471 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	IXR1	P33417	597 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	TSC13	Q99190	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	KIP2	P28743	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	ROM1	P53046	1155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	ATG20	Q07528	640 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	TRS33	Q99394	268 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	KAR5	Q04746	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	VAN1	P23642	535 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	SRS2	P12954	1174 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	MIP1	P15801	1254 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	SEC20	P28791	383 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
TRZ1	YKR079C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	HEM3	P28789	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
TRZ1	YKR079C	UBP1	P25037	809 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	ERP5	P38819	212 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	ATG1	P53104	897 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	PNP1	Q05788	311 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	HDA3	Q06623	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	PUN1	Q06991	263 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	ASF1	P32447	279 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	BDP1	P46678	594 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	UTR2	P32623	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	MKS1	P34072	584 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	CWH41	P53008	833 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	PUS5	Q06244	254 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	CYT1	P07143	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	SDH2	P21801	266 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	FBP26	P32604	452 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	VRP1	P37370	817 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	ITT1	Q04638	464 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	NTH2	P35172	780 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	TBS1	P38114	1094 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	ISU1	Q03020	165 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	BOL3	P39724	118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	CST6	P40535	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	APP1	P53933	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	RRN6	P32786	894 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75

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