RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	SOL3	P38858	249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	YPP1	P46951	817 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	YJL049W	P47048	450 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	SIT4	P20604	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	GUT1	P32190	709 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	ATH1	P48016	1211 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	YGL081W	P53156	320 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	PNP1	Q05788	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	MNN1	P39106	762 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	BDF2	Q07442	638 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	YOR238W	Q08634	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	MCM16	Q12262	181 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	UBP12	P39538	1254 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	BOI2	P39969	1040 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	TY4A-J	P47023	414 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	ACF4	P47129	309 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	SPR28	Q04921	423 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	MNN4	P36044	1178 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	QDR1	P40475	563 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	AIM21	P40563	679 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATG7	YHR171W	MCM2	P29469	868 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	MAD1	P40957	749 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	ISW1	P38144	1129 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	TAT2	P38967	592 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	DNM1	P54861	757 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	MIP1	P15801	1254 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	MTO1	P53070	669 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	SEC6	P32844	805 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	EMP47	P43555	445 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	ROM1	P53046	1155 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	YPR109W	Q06104	294 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	KAR1	P11927	433 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	PHO87	P25360	923 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	ISF1	P32488	338 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	ERP2	P39704	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	YEN1	P40028	759 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	PPM2	Q08282	695 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	GRX7	P38068	203 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	RTF1	P53064	558 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	NST1	P53935	1240 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	GPI13	Q07830	1017 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	SRS2	P12954	1174 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	CLN2	P20438	545 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	TOA1	P32773	286 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	FUI1	P38196	639 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	YOR131C	Q12486	218 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATG7	YHR171W	RAD2	P07276	1031 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	RMD1	Q03441	430 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	ENV9	Q08651	330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	NUP82	P40368	713 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	ITC1	P53125	1264 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	PUN1	Q06991	263 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	SLY41	P22215	453 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	HUL5	P53119	910 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	YOL036W	Q08206	761 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	NKP1	Q12493	238 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	CSC1	Q06538	782 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	HAP4	P14064	554 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	RTT106	P40161	455 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	DAK2	P43550	591 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	TIM23	P32897	222 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	COG4	Q06096	861 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
ATG7	YHR171W	FOL1	P53848	824 aa		7.21	□□□□□ -1.25

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