RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W FRA1Q07825 749 aa7.46□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W TEC1P18412 486 aa7.45□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W PUP1P25043 261 aa7.44□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W EMP47P43555 445 aa7.44□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W ISF1P32488 338 aa7.43□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W MRX12P47084 519 aa7.43□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W GYP1Q08484 637 aa7.43□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W VAC17P25591 423 aa7.42□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W GUT2P32191 649 aa7.42□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W APL6P46682 809 aa7.42□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W TGL4P36165 910 aa7.42□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PRD1YCL057W SDH2P21801 266 aa7.39□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W YML083CQ04526 418 aa7.39□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W ENV9Q08651 330 aa7.37□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W VRP1P37370 817 aa7.37□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W ATG3P40344 310 aa7.36□□□□□ -1.23
PRD1YCL057W GAL2P13181 574 aa7.33□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W SLX8P40072 274 aa7.33□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W KTR7P40504 517 aa7.33□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W SOH1P38633 127 aa7.31□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W BDP1P46678 594 aa7.31□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W ECM23Q02710 187 aa7.31□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W YML020WQ03722 664 aa7.31□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W IXR1P33417 597 aa7.3□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W BCK2P33306 851 aa7.3□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W ITT1Q04638 464 aa7.3□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W PHO87P25360 923 aa7.29□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W CST6P40535 587 aa7.29□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W HAL5P38970 855 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W PUS5Q06244 254 aa7.28□□□□□ -1.24
PRD1YCL057W EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W KIP2P28743 706 aa7.27□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W ACS2P52910 683 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W UBX7P38349 436 aa7.26□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W TSC13Q99190 310 aa7.26□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W HAP4P14064 554 aa7.25□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W XDJ1P39102 459 aa7.25□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W ATG20Q07528 640 aa7.25□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W ROM1P53046 1155 aa7.24□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.24□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data7.24□□□□□ -1.25not detected
PRD1YCL057W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W GAS4Q08271 471 aa7.22□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W APP1P53933 587 aa7.22□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W HDA3Q06623 655 aa7.22□□□□□ -1.25
PRD1YCL057W PDI1P17967 522 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W AMS1P22855 1083 aa7.2□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W AIM9P40053 627 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W YFL034WP43564 1073 aa7.2□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W MIP1P15801 1254 aa7.19□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W ISU1Q03020 165 aa7.19□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W FBP26P32604 452 aa7.19□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W HED1Q03937 162 aa7.19□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W HAT1Q12341 374 aa7.18□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W YBL086CP38177 466 aa7.17□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W STE6P12866 1290 aa7.16□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W UBP1P25037 809 aa7.16□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W MKS1P34072 584 aa7.16□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W NTH2P35172 780 aa7.15□□□□□ -1.26
PRD1YCL057W VAN1P23642 535 aa7.14□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W SRS2P12954 1174 aa7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W UTR2P32623 467 aa7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W SWI5P08153 709 aa7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W PNP1Q05788 311 aa7.13□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W RAS1P01119 309 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W SUV3P32580 737 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W SLD2P34252 453 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W CLA4P48562 842 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W SGS1P35187 1447 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W PUN1Q06991 263 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W MET32Q12041 191 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W TRS33Q99394 268 aa7.12□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W TRL1P09880 827 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W RTT106P40161 455 aa7.11□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W DFG5Q05031 458 aa7.11□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W CYT1P07143 309 aa7.1□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W NGR1P32831 672 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W YBL113CQ7M4S9 792 aa7.1□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W BOL3P39724 118 aa7.1□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W KAR5Q04746 504 aa7.1□□□□□ -1.27
PRD1YCL057W ERP5P38819 212 aa7.09□□□□□ -1.27
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