RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-222ENST00000592408 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPKBP1O60336 1514 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 NCOA2Q15596 1464 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF11O15085 1522 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 HFM1A2PYH4 1435 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0556O60303 1618 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 AKNAQ7Z591 1439 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIN2AQ12879 1464 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 MIA2Q96PC5 1412 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 UACAQ9BZF9 1416 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 NEUROD1Q13562 356 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 MARVELD3Q96A59 401 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNJ2O15056 1496 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 NAIPQ13075 1403 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 DISP1Q96F81 1524 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 SNPHO15079 494 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 TONSLQ96HA7 1378 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRKQ15262 1439 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 ROCK1Q13464 1354 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEB3A0JP26 581 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 POTEBQ6S5H4 581 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP170Q5SW79 1584 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP160Q12769 1436 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 G3V3G9 751 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 MICALL2Q8IY33 904 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.07□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 DAPK1P53355 1430 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PLCB2Q00722 1185 aa13.06□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX12O15370 315 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PKD2Q13563 968 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.05□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 EMP3P54852 163 aa13.03□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF14Q15058 1648 aa13.02□□□□□ -0.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RGL2O15211 777 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.01□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CROCC2H7BZ55 1655 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCA8O94911 1581 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC5O15440 1437 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM205CA6NFA0 338 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM52Q96A61 297 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 STK24Q9Y6E0 443 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRL2O95490 1459 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 MFRPQ9BY79 579 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM6BO15054 1643 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 ARID3CA6NKF2 412 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-222ENST00000592408 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms