RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NBR1Q14596 966 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 STAC3Q96MF2 364 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC4A5Q9BY07 1137 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GRXCR2A6NFK2 248 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HRO43593 1189 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP3K7O43318 606 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COL9A1P20849 921 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OSBPP22059 807 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NBPF3Q9H094 633 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PROX2Q3B8N5 592 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 VSIG10Q8N0Z9 540 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CERKQ8TCT0 537 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HCSTQ9UBK5 93 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PACS2Q86VP3 889 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SEMA3EO15041 775 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRSS12P56730 875 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WNT2BQ93097 391 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TSKSQ9UJT2 592 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NBPF26B4DH59 902 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTPN5P54829 565 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NUTM2FA1L443 756 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PADI6Q6TGC4 694 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PNMA3Q9UL41 463 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTGDRQ13258 359 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TATDN2Q93075 761 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRCH3Q96II8 777 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SMAPO00193 183 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FCHSD2O94868 740 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BCAMP50895 628 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TTC13Q8NBP0 860 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C3orf80F5H4A9 247 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HIC1Q14526 733 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC4A3P48751 1232 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP4CP60510 307 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EYA1Q99502 592 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WBP1LQ9NX94 342 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GNPATO15228 680 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RNF40O75150 1001 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NECTIN2Q92692 538 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ADGRG1Q9Y653 693 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OATP04181 439 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DNAJB2P25686 324 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLF2Q8IX21 1173 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFFO2Q5TF58 517 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RCCD1A6NED2 376 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPR37O15354 613 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM161AQ3B820 660 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FECHP22830 423 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNC4Q03721 635 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms