RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP35Q9P2H5 1018 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU6-964P-201ENST00000516524 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU6-964P-201ENST00000516524 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU6-964P-201ENST00000516524 MAP3K9P80192 1104 aa10.22□□□□□ -0.77
RNU6-964P-201ENST00000516524 SOCS7O14512 581 aa10.21□□□□□ -0.77
RNU6-964P-201ENST00000516524 OSBPP22059 807 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 FOXK1P85037 733 aa10.2□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 PTGER2P43116 358 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMC2Q8TDI7 906 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.19□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 FECHP22830 423 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 DSG2Q14126 1118 aa10.18□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 PTGDRQ13258 359 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 MAP3K13O43283 966 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 TBC1D12O60347 775 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 KIF12Q96FN5 646 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 RFC5P40937 340 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 GLMNQ92990 594 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-964P-201ENST00000516524 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 SNRKQ9NRH2 765 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 ERCC3P19447 782 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.1□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 PITPNM1O00562 1244 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU6-964P-201ENST00000516524 ABL2P42684 1182 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 PLPP6Q8IY26 295 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 WASHC4Q2M389 1173 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 OATP04181 439 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 CHADLQ6NUI6 762 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 DDX12PQ92771 950 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.04□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RNU6-964P-201ENST00000516524 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 POM121CA8CG34 1229 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 RFX1P22670 979 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCDC125Q86Z20 511 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATG7O95352 703 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 MICALL2Q8IY33 904 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 EPAS1Q99814 870 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.96□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 G3V3G9 751 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 GJA5P36382 358 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 SIRT1Q96EB6 747 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 PHOX2BQ99453 314 aa9.93□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 UNCXA6NJT0 531 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 EVI5O60447 810 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 SOX11P35716 441 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 C2orf72A6NCS6 295 aa9.91□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.91□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPTLC1O15269 473 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 CERKQ8TCT0 537 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 DRC1Q96MC2 740 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 BCL11AQ9H165 835 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-964P-201ENST00000516524 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 KIF3CO14782 793 aa9.89□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 MAP3K7O43318 606 aa9.89□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 AP1G2O75843 785 aa9.89□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.88□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 PHF14O94880 888 aa9.88□□□□□ -0.83
RNU6-964P-201ENST00000516524 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.6 ms