RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRR20BP86481 221 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRR20AP86496 221 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM212AQ96EL1 285 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 MSTNO14793 375 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 PYGBP11216 843 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 MICALL2Q8IY33 904 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 WBP1LQ9NX94 342 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 TNFRSF10AO00220 468 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 NBPF3Q9H094 633 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 AXIN1O15169 862 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-977P-201ENST00000516411 IRS1P35568 1242 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 PROM2Q8N271 834 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC4A5Q9BY07 1137 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 GALNT6Q8NCL4 622 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 ERBB4Q15303 1308 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 SOWAHBA6NEL2 793 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPDYE4A6NLX3 237 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 VEGFBP49765 207 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLURP2P0DP57 97 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUBP1P53384 320 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRIM47Q96LD4 638 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 CABP2Q9NPB3 220 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC19A1P41440 591 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 PSEN1P49768 467 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 FZD5Q13467 585 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 MIER1Q8N108 512 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADAMTS8Q9UP79 889 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 GGCXP38435 758 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 SENP2Q9HC62 589 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 GDF9O60383 454 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 CTC1Q2NKJ3 1217 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF697Q5TEC3 545 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPRYD7Q5W111 196 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 KANK3Q6NY19 840 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 H3BM21 787 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 FKBP8Q14318 412 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 TJAP1Q5JTD0 557 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZBED2Q9BTP6 218 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 AVPP01185 164 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 NPAS3Q8IXF0 933 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 PROCP04070 461 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC34A2O95436 690 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 IL21Q9HBE4 155 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 HPS5Q9UPZ3 1129 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 KIFC2Q96AC6 838 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 MTRQ99707 1265 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 FBXO3Q9UK99 471 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCO2A0A1W2PP80 73 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 FURINP09958 794 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF516Q92618 1163 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMUB1Q9BVT8 246 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 ITGB2P05107 769 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTPREP23469 700 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 BAG6P46379 1132 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 NKX2-3Q8TAU0 364 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 BCL2L12Q9HB09 334 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-977P-201ENST00000516411 TXKP42681 527 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 VASPP50552 380 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 FOXC1Q12948 553 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 NBPF11Q86T75 865 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 MARSP56192 900 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 C2orf72A6NCS6 295 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 LCE4AQ5TA78 99 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 LAPTM4BQ86VI4 370 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 PLCD3Q8N3E9 789 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 LRCH3Q96II8 777 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 RABGEF1Q9UJ41 708 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 SVOPQ8N4V2 548 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNF223E7ERA6 249 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 LIAT1Q6ZQX7 453 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF454Q8N9F8 522 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 DCAF5Q96JK2 942 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 KIF3CO14782 793 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 VSIG8P0DPA2 414 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-977P-201ENST00000516411 PKD2L1Q9P0L9 805 aa2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms