RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.58■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DRC7Q8IY82 874 aa22.58■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.57■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NGEFQ8N5V2 710 aa22.56■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STK31Q9BXU1 1019 aa22.56■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PANK3Q9H999 370 aa22.56■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CRBNQ96SW2 442 aa22.54■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.54■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC7Q96M83 1385 aa22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PHF14O94880 888 aa22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 USP47Q96K76 1375 aa22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 E9PSI1 815 aa22.52■■□□□ 1.2
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF21BO75037 1637 aa22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.5■■□□□ 1.19
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC4A3P48751 1232 aa22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HMMRO75330 724 aa22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMARCA4P51532 1647 aa22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.48■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLIN1O60240 522 aa22.48■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ST18O60284 1047 aa22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NFKBIBQ15653 356 aa22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AAMPQ13685 434 aa22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.46■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.45■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUTM2FA1L443 756 aa22.42■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.41■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.4■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.39■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 APAF1O14727 1248 aa22.37■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.37■■□□□ 1.17
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EID1Q9Y6B2 187 aa22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GPATCH3Q96I76 525 aa22.36■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GORABQ5T7V8 394 aa22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COG6Q9Y2V7 657 aa22.35■■□□□ 1.17
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MRE11P49959 708 aa22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARID3AQ99856 593 aa22.33■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MIA2Q96PC5 1412 aa22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGF1RP08069 1367 aa22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TPM4P67936 248 aa22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PTPRGP23470 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.31■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.31■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.3■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EVC2Q86UK5 1308 aa22.29■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.29■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAP7D2Q96T17 732 aa22.28■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.28■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.28■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF16BQ96L93 1317 aa22.27■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COG3Q96JB2 828 aa22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BACH2Q9BYV9 841 aa22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUCB2P80303 420 aa22.23■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TPM2P07951 284 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RILPL2Q969X0 211 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.2■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 REC8O95072 547 aa22.2■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STAC3Q96MF2 364 aa22.19■■□□□ 1.14
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