RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447046.1

AC004980.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.3, Length 365 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.3-201ENST00000447046 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 PRDM2Q13029 1718 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 NESP48681 1621 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 TBC1D12O60347 775 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 NEUROD2Q15784 382 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 ERCC6Q03468 1493 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 SOGA1O94964 1423 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 CUX1P39880 1505 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004980.3-201ENST00000447046 SYNJ1O43426 1573 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC34A2O95436 690 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 PTGER2P43116 358 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 FECHP22830 423 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 TOPBP1Q92547 1522 aa8□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 SLAIN1Q8ND83 568 aa8□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 MRC2Q9UBG0 1479 aa8□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 CUX2O14529 1486 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 GOLGA3Q08378 1498 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 NUDT7P0C024 238 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 ARSIQ5FYB1 569 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 AK7Q96M32 723 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 IGF1RP08069 1367 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004980.3-201ENST00000447046 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 TRIM66O15016 1216 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC102AQ96A19 550 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 POTEMA6NI47 508 aa7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 MAP3K7O43318 606 aa7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.95□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 GNPATO15228 680 aa7.94□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 FCHSD2O94868 740 aa7.94□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 PHF14O94880 888 aa7.94□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 PTGDRQ13258 359 aa7.94□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 IFT140Q96RY7 1462 aa7.94□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.93□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.93□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 POTEGQ6S5H5 508 aa7.93□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 PDE4DQ08499 809 aa7.92□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 MAP2K5Q13163 448 aa7.92□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 HIC1Q14526 733 aa7.92□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.92□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.92□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 IRF6O14896 467 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 FOSBP53539 338 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 DOK7Q18PE1 504 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 GPR153Q6NV75 609 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 JPH4Q96JJ6 628 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 PRXQ9BXM0 1461 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 KIF21BO75037 1637 aa7.91□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM161AQ3B820 660 aa7.9□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 EPAS1Q99814 870 aa7.9□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.9□□□□□ -1.14
AC004980.3-201ENST00000447046 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.89□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 WDR62O43379 1518 aa7.89□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.89□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.88□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 LHX6Q9UPM6 363 aa7.88□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.88□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 WDR97A6NE52 1622 aa7.88□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 IL27Q8NEV9 243 aa7.87□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 NLRP7Q8WX94 980 aa7.87□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 GRIN2BQ13224 1484 aa7.87□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 CEP162Q5TB80 1403 aa7.86□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 RIMBP2O15034 1052 aa7.86□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.86□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.86□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.86□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 CLIP1P30622 1438 aa7.86□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.85□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 PADI6Q6TGC4 694 aa7.85□□□□□ -1.15
AC004980.3-201ENST00000447046 FBXW7Q969H0 707 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms