RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 HMMRO75330 724 aa26.74■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.873e-6■■□□□ 13.2
ANKRD28-201ENST00000399451 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.71■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.7■■□□□ 1.87
ANKRD28-201ENST00000399451 EVA1CP58658 441 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.7■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 MSH5O43196 834 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 TPM4P67936 248 aa26.69■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.68■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.67■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 WIZO95785 1651 aa26.64■■□□□ 1.86
ANKRD28-201ENST00000399451 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.63■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.62■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 TOMM22Q9NS69 142 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.6■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 ST18O60284 1047 aa26.59■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.59■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 VPS53Q5VIR6 699 aa26.58■■□□□ 1.85
ANKRD28-201ENST00000399451 ARID3AQ99856 593 aa26.57■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 PHF14O94880 888 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 JPH4Q96JJ6 628 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.55■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 PANK3Q9H999 370 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 USP35Q9P2H5 1018 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM161AQ3B820 660 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 MARCH6O60337 910 aa26.52■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
ANKRD28-201ENST00000399451 PDE4AP27815 886 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF16BQ96L93 1317 aa26.5■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 E9PSI1 815 aa26.48■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 COG3Q96JB2 828 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 UACAQ9BZF9 1416 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 PDE4CQ08493 712 aa26.47■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.46■■□□□ 1.83
ANKRD28-201ENST00000399451 PLIN1O60240 522 aa26.45■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 CRBNQ96SW2 442 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF3AQ9Y496 699 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 USP47Q96K76 1375 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 NGEFQ8N5V2 710 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 OSCARQ8IYS5 282 aa26.41■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.4■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.39■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ANKRD28-201ENST00000399451 TEFQ10587 303 aa26.39■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 KLHL34Q8N239 644 aa26.38■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC4A3P48751 1232 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 RILPL2Q969X0 211 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 PSME1Q06323 249 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 GSE1Q14687 1217 aa26.37■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 RAD21O60216 631 aa26.36■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 EVC2Q86UK5 1308 aa26.35■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 FBXW7Q969H0 707 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 H3BQV1 296 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 IFFO2Q5TF58 517 aa26.34■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 PTPRGP23470 1445 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 COG6Q9Y2V7 657 aa26.33■■□□□ 1.81
ANKRD28-201ENST00000399451 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.32■■□□□ 1.8
ANKRD28-201ENST00000399451 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.32■■□□□ 1.8
ANKRD28-201ENST00000399451 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms