RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 EID1Q9Y6B2 187 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 AMPHP49418 695 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 APAF1O14727 1248 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF21BO75037 1637 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 GBP4Q96PP9 640 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 HMMRO75330 724 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CRBNQ96SW2 442 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 EVC2Q86UK5 1308 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 COG6Q9Y2V7 657 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4-202ENST00000392011 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 35.4
SH3BP4-202ENST00000392011 E9PSI1 815 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 PDE4AP27815 886 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 UACAQ9BZF9 1416 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC7Q96M83 1385 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 NCAPD3P42695 1498 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 NRDCO43847 1150 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 COG3Q96JB2 828 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC4A3P48751 1232 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-202ENST00000392011 ARAP1Q96P48 1450 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 DRC7Q8IY82 874 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GORABQ5T7V8 394 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM161AQ3B820 660 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OSCARQ8IYS5 282 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NCOA2Q15596 1464 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-202ENST00000392011 AFAP1Q8N556 730 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 GPATCH3Q96I76 525 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 RIPK4P57078 832 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 PTMSP20962 102 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 CUX1P39880 1505 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BP4-202ENST00000392011 RILPL2Q969X0 211 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ST18O60284 1047 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNJ1O43426 1573 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 TEFQ10587 303 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CFTRP13569 1480 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 RUNDC1Q96C34 613 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 NECTIN2Q92692 538 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 NGEFQ8N5V2 710 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 STAC3Q96MF2 364 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CABP2Q9NPB3 220 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 HMOX1P09601 288 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP4-202ENST00000392011 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.31■■□□□ 1
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