RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAP2K5Q13163 448 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCDC102AQ96A19 550 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 C2orf72A6NCS6 295 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 G3V3G9 751 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 GPR153Q6NV75 609 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 GNPATO15228 680 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 FCHSD2O94868 740 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 OSBPP22059 807 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 PTGER2P43116 358 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 AMHR2Q16671 573 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-441P-201ENST00000384545 KIF3CO14782 793 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 HIC1Q14526 733 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 FLIIQ13045 1269 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 RIMBP2O15034 1052 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 TBC1D12O60347 775 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 FECHP22830 423 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 OXER1Q8TDS5 423 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 DDX12PQ92771 950 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 GOPCQ9HD26 462 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARID3AQ99856 593 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-441P-201ENST00000384545 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 EVI5O60447 810 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PTGDRQ13258 359 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 APBB1O00213 710 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARSIQ5FYB1 569 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARID3CA6NKF2 412 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 MS4A1P11836 297 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 A6NJR5 290 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 CLCN1P35523 988 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 EPAS1Q99814 870 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRAK2O60296 914 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 HCSTQ9UBK5 93 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAP3K7O43318 606 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 PHF14O94880 888 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 HRCP23327 699 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC34A2O95436 690 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 MCM6Q14566 821 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 OATP04181 439 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 PBX2P40425 430 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 PHOX2BQ99453 314 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 RAD21O60216 631 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 FBXW7Q969H0 707 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-441P-201ENST00000384545 NUDT7P0C024 238 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 CERKQ8TCT0 537 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 LHX6Q9UPM6 363 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM161AQ3B820 660 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 HRO43593 1189 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms