RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 GBP4Q96PP9 640 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 STK26Q9P289 416 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 PRDM2Q13029 1718 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 MAP3K1Q13233 1512 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 GSE1Q14687 1217 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-202ENST00000373779 PTMSP20962 102 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 NAIPQ13075 1403 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC184Q52MB2 194 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 AKNAQ7Z591 1439 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 APAF1O14727 1248 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.115e-6■■■■□ 20.5
PTPRU-202ENST00000373779 PTPRGP23470 1445 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-202ENST00000373779 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 TOPBP1Q92547 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 HECW1Q76N89 1606 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 MCCP23508 829 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 COG6Q9Y2V7 657 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 PLEKHG5O94827 1062 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 NGEFQ8N5V2 710 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 PLCB2Q00722 1185 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 APBB1O00213 710 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-202ENST00000373779 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 DAPK1P53355 1430 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 GRIN2BQ13224 1484 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 NESP48681 1621 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 SOX12O15370 315 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 MAPKBP1O60336 1514 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-202ENST00000373779 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 KCNJ4P48050 445 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 NFKBIBQ15653 356 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 ROCK1Q13464 1354 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 MSH5O43196 834 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 STAC3Q96MF2 364 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 CUL7Q14999 1698 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 EVC2Q86UK5 1308 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 RUNDC1Q96C34 613 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-202ENST00000373779 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 MLECQ14165 292 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 BACH2Q9BYV9 841 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 PPP2R1AP30153 589 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 NCOA1Q15788 1441 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 HMMRO75330 724 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 PANK1Q8TE04 598 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 FGD1P98174 961 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 AAMPQ13685 434 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms