RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.42■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.42■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.4■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.39■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.37■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 NEFLP07196 543 aa18.36■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.35■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.35■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.35■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 ABCC1P33527 1531 aa18.34■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 USP47Q96K76 1375 aa18.34■□□□□ 0.53
HCN3-201ENST00000368358 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.33■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 MRS2Q9HD23 443 aa18.33■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.32■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.32■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.32■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.32■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 TSPOAP1O95153 1857 aa18.31■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 FKBP8Q14318 412 aa18.3■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 ATP7AQ04656 1500 aa18.29■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 STK26Q9P289 416 aa18.28■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 ERBINQ96RT1 1412 aa18.27■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.27■□□□□ 0.52
HCN3-201ENST00000368358 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 A2MP01023 1474 aa18.27■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.25■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.25■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.25■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.24■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.24■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.24■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 CCER2I3L3R5 266 aa18.23■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.23■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.23■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 CCDC184Q52MB2 194 aa18.21■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 TMC1Q8TDI8 760 aa18.21■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
HCN3-201ENST00000368358 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.2■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.2■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 CCDC7Q96M83 1385 aa18.2■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.16■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 TMF1P82094 1093 aa18.16■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 IDI1Q13907 227 aa18.16■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 PLA2R1Q13018 1463 aa18.15■□□□□ 0.5
HCN3-201ENST00000368358 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 NEO1Q92859 1461 aa18.13■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.11■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.11■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 PLXNC1O60486 1568 aa18.1■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.1■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 POGKQ9P215 609 aa18.1■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HCN3-201ENST00000368358 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.08■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 PANK3Q9H999 370 aa18.07■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 ATP10AO60312 1499 aa18.06■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.06■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.05■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.05■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 NOS1P29475 1434 aa18.04■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 NPATQ14207 1427 aa18.04■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.04■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.03■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.02■□□□□ 0.48
HCN3-201ENST00000368358 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.01■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.01■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 NUTM2FA1L443 756 aa18.01■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 CDCA8Q53HL2 280 aa18■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 UNC13BO14795 1591 aa18■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.99■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.98■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 DIP2BQ9P265 1576 aa17.98■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.96■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HCN3-201ENST00000368358 PLEKHG5O94827 1062 aa17.95■□□□□ 0.46
HCN3-201ENST00000368358 ABCA6Q8N139 1617 aa17.94■□□□□ 0.46
HCN3-201ENST00000368358 E9PCH4 1651 aa17.94■□□□□ 0.46
HCN3-201ENST00000368358 CABP2Q9NPB3 220 aa17.94■□□□□ 0.46
HCN3-201ENST00000368358 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.93■□□□□ 0.46
HCN3-201ENST00000368358 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.93■□□□□ 0.46
HCN3-201ENST00000368358 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.92■□□□□ 0.46
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