RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP35Q9P2H5 1018 aa20.25■□□□□ 0.83
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF3AQ9Y496 699 aa20.23■□□□□ 0.83
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.23■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRXQ9BXM0 1461 aa20.23■□□□□ 0.83
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYNJ1O43426 1573 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HFM1A2PYH4 1435 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.21■□□□□ 0.83
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.21■□□□□ 0.83
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARAP1Q96P48 1450 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TPM4P67936 248 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.18■□□□□ 0.82
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.18■□□□□ 0.82
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RUNDC1Q96C34 613 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APAF1O14727 1248 aa20.14■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE4AP27815 886 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HECW1Q76N89 1606 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF16BQ96L93 1317 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TEFQ10587 303 aa20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TOPBP1Q92547 1522 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CRBNQ96SW2 442 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.1■□□□□ 0.81
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