RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 ERBINQ96RT1 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 UNC13BO14795 1591 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 DIP2BQ9P265 1576 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 GLI2P10070 1586 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 NEO1Q92859 1461 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX11-201ENST00000359238 RAPGEF3O95398 923 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX11-201ENST00000359238 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX11-201ENST00000359238 KDM5CP41229 1560 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX11-201ENST00000359238 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX11-201ENST00000359238 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 PLA2R1Q13018 1463 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 TSPOAP1O95153 1857 aa26.05■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 KIF3BO15066 747 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.03■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SNX11-201ENST00000359238 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 A2MP01023 1474 aa25.98■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 RICTORQ6R327 1708 aa25.97■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 ABCA6Q8N139 1617 aa25.96■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 DEPDC5O75140 1603 aa25.96■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.95■■□□□ 1.75
SNX11-201ENST00000359238 E9PCH4 1651 aa25.95■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.94■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.94■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.93■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 RGL3Q3MIN7 710 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 KANK1Q14678 1352 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.89■■□□□ 1.74
SNX11-201ENST00000359238 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.89■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.86■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 GGT6Q6P531 493 aa25.86■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.86■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 ATP10AO60312 1499 aa25.84■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 FKBP8Q14318 412 aa25.83■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.83■■□□□ 1.73
SNX11-201ENST00000359238 BCANQ96GW7 911 aa25.82■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 TET3O43151 1660 aa25.81■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.8■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 CEP152O94986 1710 aa25.8■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.79■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.78■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 CLTCL1P53675 1640 aa25.76■■□□□ 1.72
SNX11-201ENST00000359238 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.76■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.76■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 USP47Q96K76 1375 aa25.75■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 TRPM2O94759 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 PTPRTO14522 1441 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.72■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.71■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 CCDC7Q96M83 1385 aa25.71■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.71■■□□□ 1.71
SNX11-201ENST00000359238 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 NEFLP07196 543 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 ABCC3O15438 1527 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 NPATQ14207 1427 aa25.66■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.65■■□□□ 1.7
SNX11-201ENST00000359238 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.62■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 MROH2AA6NES4 1674 aa25.6■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.59■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.59■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.59■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.58■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 ANP32CO43423 234 aa25.58■■□□□ 1.69
SNX11-201ENST00000359238 MSH5O43196 834 aa25.57■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.57■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 MADDQ8WXG6 1647 aa25.57■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 MLECQ14165 292 aa25.57■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 REREQ9P2R6 1566 aa25.56■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 AGLP35573 1532 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 KIF1BO60333 1816 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX11-201ENST00000359238 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX11-201ENST00000359238 CCER2I3L3R5 266 aa25.51■■□□□ 1.67
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