RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356575.8

MEGF6-202, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 5,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-202ENST00000356575 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.78■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 SMARCA2P51531 1590 aa25.78■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 G3V3G9 751 aa25.78■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.78■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.76■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.74■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.74■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.74■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.74■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.73■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 TOMM22Q9NS69 142 aa25.72■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
MEGF6-202ENST00000356575 JPH4Q96JJ6 628 aa25.69■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.68■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 KIF15Q9NS87 1388 aa25.68■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 ST18O60284 1047 aa25.68■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.67■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 KIF3AQ9Y496 699 aa25.67■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 KIF16BQ96L93 1317 aa25.66■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.66■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.66■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.65■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 PANK3Q9H999 370 aa25.64■■□□□ 1.7
MEGF6-202ENST00000356575 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 COG3Q96JB2 828 aa25.63■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.61■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.6■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 UACAQ9BZF9 1416 aa25.6■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.59■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 MARCH6O60337 910 aa25.59■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.58■■□□□ 1.69
MEGF6-202ENST00000356575 EVC2Q86UK5 1308 aa25.58■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 PHF14O94880 888 aa25.57■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 RILPL2Q969X0 211 aa25.57■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 TEFQ10587 303 aa25.56■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.56■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 VPS53Q5VIR6 699 aa25.55■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.54■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.54■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 E9PSI1 815 aa25.53■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 ARID3AQ99856 593 aa25.52■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 EVA1CP58658 441 aa25.52■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 H3BQV1 296 aa25.52■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 IFFO2Q5TF58 517 aa25.52■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
MEGF6-202ENST00000356575 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.51■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 PDE4CQ08493 712 aa25.51■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 TPM3P06753 285 aa25.5■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.5■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 CEP89Q96ST8 783 aa25.5■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.49■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.49■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.47■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.47■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.47■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.46■■□□□ 1.67
MEGF6-202ENST00000356575 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.45■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.45■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 PTPRGP23470 1445 aa25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 PLIN1O60240 522 aa25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 NGEFQ8N5V2 710 aa25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 FAM161AQ3B820 660 aa25.44■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.43■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 COG6Q9Y2V7 657 aa25.42■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 USP47Q96K76 1375 aa25.42■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 APAF1O14727 1248 aa25.4■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.4■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 MSH5O43196 834 aa25.39■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
MEGF6-202ENST00000356575 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.37■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 PDE4AP27815 886 aa25.37■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.37■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.37■■□□□ 1.65
MEGF6-202ENST00000356575 CRBNQ96SW2 442 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms