RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C8orf34Q49A92 452 aa29.68■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.66■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.66■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.65■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKD2Q13563 968 aa29.64■■■□□ 2.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.61■■■□□ 2.33
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQGAP2Q13576 1575 aa29.56■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.56■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADGRL2O95490 1459 aa29.54■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARID3CA6NKF2 412 aa29.53■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKNOX2Q96KN3 472 aa29.52■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.48■■■□□ 2.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.48■■■□□ 2.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa29.47■■■□□ 2.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POGKQ9P215 609 aa29.44■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.44■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.44■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.43■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.4■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.4■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP170Q5SW79 1584 aa29.39■■■□□ 2.3
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP19O94966 1318 aa29.38■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGS3P49796 1198 aa29.38■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.37■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUP155O75694 1391 aa29.36■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.34■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BECN1Q14457 450 aa29.33■■■□□ 2.29
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.33■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.3■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.29■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.28■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PBRM1Q86U86 1689 aa29.28■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF521Q96K83 1311 aa29.27■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.27■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLCN1P35523 988 aa29.27■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA2Q08379 1002 aa29.27■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.26■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PANK3Q9H999 370 aa29.26■■■□□ 2.28
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.26■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.24■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADAMTS12P58397 1594 aa29.24■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP9O43818 475 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NLRP1Q9C000 1473 aa29.24■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAMC1P11047 1609 aa29.23■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FSD2A1L4K1 749 aa29.23■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA0556O60303 1618 aa29.22■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRGP23470 1445 aa29.21■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.21■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.27
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZMYND15Q9H091 742 aa29.2■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.2■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.2■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLFN5Q08AF3 891 aa29.19■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TESK2Q96S53 571 aa29.19■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.18■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DISP1Q96F81 1524 aa29.17■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.17■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERBINQ96RT1 1412 aa29.17■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.16■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.16■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEC24BO95487 1268 aa29.14■■■□□ 2.26
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.14■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHDP01880 384 aa29.13■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMF1P82094 1093 aa29.12■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERCC6Q03468 1493 aa29.12■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP2R1AP30153 589 aa29.1■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.09■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.08■■■□□ 2.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.07■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZMYM3Q14202 1370 aa29.07■■■□□ 2.24
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