RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.66■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.65■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.64■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 NGEFQ8N5V2 710 aa25.64■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 NRDCO43847 1150 aa25.63■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 NCOA2Q15596 1464 aa25.63■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 AMPHP49418 695 aa25.62■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.6■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 APBB1O00213 710 aa25.6■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 HMGXB3Q12766 1538 aa25.6■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 GBP4Q96PP9 640 aa25.59■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 SYNJ1O43426 1573 aa25.59■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.58■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 E9PSI1 815 aa25.58■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 PLCB2Q00722 1185 aa25.58■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
LRIG1-201ENST00000273261 MIA2Q96PC5 1412 aa25.56■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 GPATCH3Q96I76 525 aa25.56■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 PRDM2Q13029 1718 aa25.55■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 COG3Q96JB2 828 aa25.54■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 TOP2BQ02880 1626 aa25.53■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 ARAP1Q96P48 1450 aa25.52■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.52■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
LRIG1-201ENST00000273261 PRXQ9BXM0 1461 aa25.51■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC7Q96M83 1385 aa25.5■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.5■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 SYNJ2O15056 1496 aa25.49■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.48■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.48■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 IFT140Q96RY7 1462 aa25.48■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.47■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.47■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.45■■□□□ 1.67
LRIG1-201ENST00000273261 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.45■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.45■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.43■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.42■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 TOPBP1Q92547 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 GORABQ5T7V8 394 aa25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 NUTM2FA1L443 756 aa25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
LRIG1-201ENST00000273261 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.37■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 APAF1O14727 1248 aa25.37■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.37■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 HFM1A2PYH4 1435 aa25.36■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.34■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 FAM161AQ3B820 660 aa25.34■■□□□ 1.65
LRIG1-201ENST00000273261 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.32■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 HECW1Q76N89 1606 aa25.32■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 ST18O60284 1047 aa25.32■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 RUNDC1Q96C34 613 aa25.32■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.32■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.32■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.31■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.31■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 NESP48681 1621 aa25.31■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.31■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.31■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 DRC7Q8IY82 874 aa25.29■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 CRBNQ96SW2 442 aa25.29■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 TIAM1Q13009 1591 aa25.29■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 TEFQ10587 303 aa25.28■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 AAMPQ13685 434 aa25.27■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.27■■□□□ 1.64
LRIG1-201ENST00000273261 PDE4AP27815 886 aa25.26■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 PLIN1O60240 522 aa25.26■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms