RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.69□□□□□ -0.54
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GINS1-201ENST00000262460 KDM5CP41229 1560 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.67□□□□□ -0.54
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GINS1-201ENST00000262460 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS1-201ENST00000262460 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.61□□□□□ -0.55
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GINS1-201ENST00000262460 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.6□□□□□ -0.55
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GINS1-201ENST00000262460 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.58□□□□□ -0.55
GINS1-201ENST00000262460 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.58□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.58□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 RALBP1Q15311 655 aa11.58□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.57□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 CRBNQ96SW2 442 aa11.57□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.56□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 TMF1P82094 1093 aa11.56□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 NEUROD2Q15784 382 aa11.56□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 CHD1O14646 1710 aa11.55□□□□□ -0.56
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GINS1-201ENST00000262460 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
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GINS1-201ENST00000262460 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.53□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.53□□□□□ -0.56
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GINS1-201ENST00000262460 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.52□□□□□ -0.56
GINS1-201ENST00000262460 GGT6Q6P531 493 aa11.52□□□□□ -0.57
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GINS1-201ENST00000262460 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.52□□□□□ -0.57
GINS1-201ENST00000262460 PPP2R1AP30153 589 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS1-201ENST00000262460 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
GINS1-201ENST00000262460 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.51□□□□□ -0.57
GINS1-201ENST00000262460 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.5□□□□□ -0.57
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GINS1-201ENST00000262460 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.5□□□□□ -0.57
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GINS1-201ENST00000262460 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
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GINS1-201ENST00000262460 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
GINS1-201ENST00000262460 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.47□□□□□ -0.57
GINS1-201ENST00000262460 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.46□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.45□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 PLCH2O75038 1416 aa11.45□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 ABCC2Q92887 1545 aa11.44□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.43□□□□□ -0.58
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