RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 NUP155O75694 1391 aa27.45■■□□□ 1.99
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.44■■□□□ 1.98
PRRT1-201ENST00000211413 MLECQ14165 292 aa27.42■■□□□ 1.98
PRRT1-201ENST00000211413 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.41■■□□□ 1.98
PRRT1-201ENST00000211413 PZPP20742 1482 aa27.4■■□□□ 1.98
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PRRT1-201ENST00000211413 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PRRT1-201ENST00000211413 UNC13BO14795 1591 aa27.37■■□□□ 1.97
PRRT1-201ENST00000211413 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.36■■□□□ 1.97
PRRT1-201ENST00000211413 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PRRT1-201ENST00000211413 DEPDC5O75140 1603 aa27.32■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 PKD2Q13563 968 aa27.32■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.32■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 REREQ9P2R6 1566 aa27.29■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.28■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.28■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 CEP152O94986 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.27■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.27■■□□□ 1.96
PRRT1-201ENST00000211413 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.25■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 AGLP35573 1532 aa27.24■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 KANK1Q14678 1352 aa27.23■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.23■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 NEUROD1Q13562 356 aa27.21■■□□□ 1.95
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC3O15438 1527 aa27.17■■□□□ 1.94
PRRT1-201ENST00000211413 E9PCH4 1651 aa27.17■■□□□ 1.94
PRRT1-201ENST00000211413 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PRRT1-201ENST00000211413 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PRRT1-201ENST00000211413 TET3O43151 1660 aa27.13■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.13■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.12■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.1■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.09■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 PLA2R1Q13018 1463 aa27.09■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.08■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 NPATQ14207 1427 aa27.08■■□□□ 1.93
PRRT1-201ENST00000211413 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PRRT1-201ENST00000211413 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PRRT1-201ENST00000211413 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PRRT1-201ENST00000211413 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.03■■□□□ 1.92
PRRT1-201ENST00000211413 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.01■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 ZMYM3Q14202 1370 aa27.01■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.01■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.99■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 MADDQ8WXG6 1647 aa26.98■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRTO14522 1441 aa26.95■■□□□ 1.91
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.94■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.93■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.93■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 CLTCL1P53675 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 RGL3Q3MIN7 710 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.92■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 SYNMO15061 1565 aa26.91■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 TRPM2O94759 1503 aa26.91■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 NOS1P29475 1434 aa26.9■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 C3P01024 1663 aa26.89■■□□□ 1.9
PRRT1-201ENST00000211413 ERVK-7P63135 1459 aa26.88■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.87■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.87■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 IDI1Q13907 227 aa26.86■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 TONSLQ96HA7 1378 aa26.86■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 MROH2AA6NES4 1674 aa26.85■■□□□ 1.89
PRRT1-201ENST00000211413 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.81■■□□□ 1.88
PRRT1-201ENST00000211413 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.8■■□□□ 1.88
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.8■■□□□ 1.88
PRRT1-201ENST00000211413 PIK3C2BO00750 1634 aa26.77■■□□□ 1.88
PRRT1-201ENST00000211413 TNRQ92752 1358 aa26.77■■□□□ 1.88
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.77■■□□□ 1.88
PRRT1-201ENST00000211413 KIF1BO60333 1816 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRMP28827 1452 aa26.74■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.73■■□□□ 1.87
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.7■■□□□ 1.86
PRRT1-201ENST00000211413 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.7■■□□□ 1.86
PRRT1-201ENST00000211413 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PRRT1-201ENST00000211413 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.67■■□□□ 1.86
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRB3O60242 1522 aa26.67■■□□□ 1.86
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.66■■□□□ 1.86
PRRT1-201ENST00000211413 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.61■■□□□ 1.85
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.6■■□□□ 1.85
PRRT1-201ENST00000211413 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.6■■□□□ 1.85
PRRT1-201ENST00000211413 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.58■■□□□ 1.85
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP1Q9C000 1473 aa26.55■■□□□ 1.84
PRRT1-201ENST00000211413 IFT172Q9UG01 1749 aa26.55■■□□□ 1.84
PRRT1-201ENST00000211413 PPLO60437 1756 aa26.55■■□□□ 1.84
PRRT1-201ENST00000211413 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PRRT1-201ENST00000211413 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.54■■□□□ 1.84
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