RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194894.3

Ankrd39-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ccnb3Q810T2 1396 aa27.17■■□□□ 1.94
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif3bQ61771 747 aa27.13■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa27.11■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa27.1■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rapgef3Q8VCC8 918 aa27.1■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Naip5Q9R016 1403 aa27.08■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa27.08■■□□□ 1.93
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Bcl11bQ99PV8 884 aa27.07■■□□□ 1.92
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rims2Q9EQZ7 1530 aa27.04■■□□□ 1.92
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Uggt2E9Q4X2 1504 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fmn2Q9JL04 1578 aa27.03■■□□□ 1.92
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rsph4aQ8BYM7 716 aa27■■□□□ 1.91
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Abcc6Q9R1S7 1498 aa26.99■■□□□ 1.91
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa26.97■■□□□ 1.91
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif7B7ZNG0 1348 aa26.96■■□□□ 1.91
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prdm16A2A935 1275 aa26.95■■□□□ 1.9
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PzpQ61838 1495 aa26.93■■□□□ 1.9
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Plch2A2AP18 1501 aa26.92■■□□□ 1.9
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa26.92■■□□□ 1.9
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mast1Q9R1L5 1570 aa26.88■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Abca17E9PX95 1733 aa26.87■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa26.86■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hfm1D3Z4R1 1434 aa26.84■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa26.84■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mtus2Q3UHD3 1353 aa26.77■■□□□ 1.88
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Abcc5Q9R1X5 1436 aa26.76■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Robo2Q7TPD3 1470 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Myo5cE9Q1F5 1742 aa26.75■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Asxl1P59598 1514 aa26.73■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prex1Q69ZK0 1650 aa26.73■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fbln2P37889 1221 aa26.71■■□□□ 1.87
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adamts7Q68SA9 1657 aa26.67■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Plekhh2Q8C115 1491 aa26.67■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ShprhQ7TPQ3 1674 aa26.66■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ssh2Q5SW75 1423 aa26.65■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Amigo3Q8C2S7 508 aa26.64■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cabp1Q9JLK7 227 aa26.64■■□□□ 1.86
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Akap12Q9WTQ5 1684 aa26.62■■□□□ 1.85
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Vps8Q0P5W1 1427 aa26.62■■□□□ 1.85
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa26.6■■□□□ 1.85
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 DnmbpQ6TXD4 1580 aa26.57■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Med1Q925J9 1575 aa26.57■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tom1O88746 492 aa26.56■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif13aQ9EQW7 1749 aa26.56■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa26.55■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Chic2Q9D9G3 165 aa26.55■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Txndc2Q6P902 515 aa26.53■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nyap1Q6PFX7 833 aa26.52■■□□□ 1.84
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fhad1A6PWD2 1420 aa26.51■■□□□ 1.83
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pde4cQ3UEI1 686 aa26.51■■□□□ 1.83
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Setd1aE9PYH6 1716 aa26.48■■□□□ 1.83
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa26.46■■□□□ 1.83
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cypt2Q6P924 180 aa26.46■■□□□ 1.83
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa26.45■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slit2Q9R1B9 1521 aa26.44■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Il16O54824 1322 aa26.43■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mbd5B1AYB6 1498 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Brinp3Q499E0 766 aa26.42■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.41■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gimap5Q8BWF2 308 aa26.39■■□□□ 1.82
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pik3c2aQ61194 1686 aa26.38■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Skint5A7XUY5 1461 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 P3h3Q8CG70 732 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ttc21bQ0HA38 1315 aa26.37■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Col18a1P39061 1774 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm13695A2AK44 830 aa26.36■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 IghaA0A0A6YXW6 389 aa26.35■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Naip7Q9JIB3 1402 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Myo3aQ8K3H5 1613 aa26.33■■□□□ 1.81
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa26.31■■□□□ 1.8
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Psme1P97371 249 aa26.3■■□□□ 1.8
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa26.27■■□□□ 1.8
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif21bQ9QXL1 1668 aa26.27■■□□□ 1.8
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Evi5lH3BKQ3 813 aa26.26■■□□□ 1.79
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ttll13A4Q9F6 804 aa26.24■■□□□ 1.79
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ino80Q6ZPV2 1559 aa26.24■■□□□ 1.79
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 AnkarA2RT91 1465 aa26.23■■□□□ 1.79
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sema6bO54951 886 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 85.1 ms