RNA–Protein interactions for RNA: YJR138W

IML1, Transcript of GTPase-activating protein (GAP), subunit of SEA and Iml1p complexes, yeast

Gene IML1, Length 4,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IML1	YJR138W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YPL107W	Q02873	248 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TDA1	Q03533	586 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TVP15	Q03860	143 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ULA1	Q12059	462 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YOL163W	P0CF20	169 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MSI1	P13712	422 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MRPL25	P23369	157 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SEC65	P29478	273 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RIM2	P38127	377 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CCZ1	P38273	704 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	COS111	P38308	924 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CHA4	P43634	648 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	UBP2	Q01476	1272 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	UGO1	Q03327	502 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	GMC2	Q06201	188 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SAS5	Q99314	248 aa		1.06	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SCEI	P03882	235 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	NAM2	P11325	894 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	APD1	P38281	316 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ICS2	P38284	255 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SIC1	P38634	284 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RFC2	P40348	353 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YIL166C	P40445	542 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SED1	Q01589	338 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TAF12	Q03761	539 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ATG26	Q06321	1198 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SNA4	Q07549	140 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MSA1	Q08471	629 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RHO2	P06781	192 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ALG7	P07286	448 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MCM1	P11746	286 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SAN1	P22470	610 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ERG4	P25340	473 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	REC114	P32841	428 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	PTM1	P32857	523 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ETR1	P38071	380 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MAM33	P40513	266 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MPH1	P40562	993 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	IRC7	P43623	340 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MTM1	P53320	366 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TIM10	P87108	93 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SCS7	Q03529	384 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SWF1	Q04629	336 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YPR097W	Q06839	1073 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	MCH4	Q08268	501 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	TOR1	P35169	2470 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YFL068W	P0CX99	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SPS100	P13130	326 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SEC17	P32602	292 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YSC84	P32793	468 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	PTR2	P32901	601 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YOX1	P34161	385 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SPC34	P36131	295 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	THI2	P38141	450 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.05	□□□□□ -2.24	not detected
IML1	YJR138W	BZZ1	P38822	633 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YJR012C	P47087	207 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ECM27	P47144	725 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YNR062C	P53748	327 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RMI1	Q02685	241 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	VHS3	Q08438	674 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YPR064W	Q12492	139 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	SRN2	Q99176	213 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	ENA1	P13587	1091 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	GPI12	P23797	304 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YBR144C	P34215	104 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YKL187C	P34231	750 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	OSH7	P38755	437 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	QDR2	P40474	542 aa		1.05	□□□□□ -2.24
IML1	YJR138W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.2 ms