RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C ATP4P05626 244 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PMR1P13586 950 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C IMG1P25626 169 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CSM1P25651 190 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C IDH2P28241 369 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SRB5P32585 307 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SEC17P32602 292 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TRS65P32893 560 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PDR3P33200 976 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPT5P33297 434 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SPO23P33757 523 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MRPL17P36528 281 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BNA4P38169 460 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C FZO1P38297 855 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YLF2P38746 405 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MNL1P38888 796 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PAC11P40960 533 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C IAH1P41734 238 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PRM10P42946 383 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UPF3P48412 387 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MSY1P48527 492 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SDT1P53078 280 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ROG1P53118 685 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RTS3P53289 263 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GOR1P53839 350 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ASI1P54074 624 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SED5Q01590 340 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPM2Q02773 1202 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MMT1Q03218 510 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YDR476CQ03362 224 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DYN3Q04949 312 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DIC1Q06143 298 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BOP2Q06150 570 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GGA1Q06336 557 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BCP1Q06338 283 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C REX4Q08237 289 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RRP40Q08285 240 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MMT2Q08970 484 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GET4Q12125 312 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C NSL1Q12143 216 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YDR061WQ12298 539 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SNF8Q12483 233 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YPR064WQ12492 139 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ARG3P05150 338 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C STE7P06784 515 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C COR1P07256 457 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RAP1P11938 827 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UNG1P12887 359 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATP7P30902 174 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CAT2P32796 670 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SSO1P32867 290 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SUI1P32911 108 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MRPL15P36523 253 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ROT2P38138 954 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C IST2P38250 946 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C FAD1P38913 306 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UME6P39001 836 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MAM33P40513 266 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YIL001WP40560 513 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GAB1P41733 394 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PMT4P46971 762 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C HOC1P47124 396 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C IBA57P47158 497 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RAD17P48581 401 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C DIA3P52290 468 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GET1P53192 235 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YNL234WP53857 426 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MSC1Q03104 513 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ACL4Q03771 387 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C HSP31Q04432 237 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C APC4Q04601 652 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATG26Q06321 1198 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C VPS74Q06385 345 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YLL007CQ07799 665 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PSR1Q07800 427 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YOL131WQ08270 108 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YOL159CQ08300 171 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPN6Q12377 434 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ADF1Q2V2Q1 113 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YOL087CQ99247 1116 aa2.06□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C THP2O13539 261 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
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