RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	IKI1	P38874	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	FIG4	P42837	879 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YJL132W	P47014	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	JAC1	P53193	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	INN1	P53901	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	STD1	Q02794	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RAD14	P28519	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SRB6	P32570	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YHK8	P38776	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	AIM23	P47015	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YJL045W	P47052	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YJR115W	P47152	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PEX31	P53203	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ATG4	P53867	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	BLS1	Q06071	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	CTS2	Q06350	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	TPO4	Q12256	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RAD18	P10862	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	REV1	P12689	985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CYK3	YDL117W	YKU70	P32807	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	DTR1	P38125	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ARN1	P38731	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	GPI16	P38875	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	HAT2	P39984	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	BIO3	P50277	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YGR126W	P53274	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SHH3	Q04487	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	FDH1	Q08911	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PRM4	Q12498	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PRE8	P23639	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	AXL2	P38928	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	FAA2	P39518	744 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ELO3	P40319	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	LRO1	P40345	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PRK1	P40494	810 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SHR5	P41912	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YJL163C	P46996	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SGF73	P53165	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YIP3	P53633	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	TMN2	Q04562	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PUS5	Q06244	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	OXR1	Q08952	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	NMD4	Q12129	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YER152C	P10356	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	DAD2	P36162	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	BNA4	P38169	460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	MBA1	P38300	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RCK1	P38622	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PGD1	P40356	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ALY2	P47029	1046 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YJR149W	P47177	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	TRM9	P49957	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YDR366C	P87287	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	NAM2	P11325	894 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	ADK2	P26364	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	RML2	P32611	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	UGX2	P32772	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	PDC2	P32896	925 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	GMH1	P36125	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	VPS52	P39904	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	AFG3	P39925	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CYK3	YDL117W	EAF5	P39995	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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