RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	SGF73	P53165	657 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	AAT1	Q01802	451 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	VID22	Q05934	901 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	COR1	P07256	457 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SNF4	P12904	322 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	CDC26	P14724	124 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	CTR86	P25355	563 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	CNE1	P27825	502 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	HIR2	P32480	875 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YOR062C	P36025	268 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	IFA38	P38286	347 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	STP2	P38704	541 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	PEX18	P38855	283 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YHR177W	P38867	453 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ELP2	P42935	788 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	IDS2	P46958	469 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ASK10	P48361	1146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	BUD17	P53727	317 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SED5	Q01590	340 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SWP1	Q02795	286 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	APC2	Q12440	853 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SKM1	Q12469	655 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SEC39	Q12745	709 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	HOM3	P10869	527 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MER1	P16523	270 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	CWP1	P28319	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MTC7	P32633	139 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MSN2	P33748	704 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	LHS1	P36016	881 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SLM4	P38247	162 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	TRR2	P38816	342 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MNL1	P38888	796 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	APS3	P47064	194 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	STE24	P47154	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	BIO3	P50277	480 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	GPG1	P53130	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	TWF1	P53250	332 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YGR168C	P53293	376 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RHO4	Q00246	291 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SPR6	Q01684	191 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YSA1	Q01976	231 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	URC2	Q04411	772 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	APC4	Q04601	652 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MRX4	Q12467	430 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	TFS1	P14306	219 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	AAC3	P18238	307 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	HOP1	P20050	605 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	IMG1	P25626	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	VPS51	P36116	164 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	GOS1	P38736	223 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	BIG1	P38813	335 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SPO73	P40031	143 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MSS2	P40990	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	CIS3	P47001	227 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MDE1	P47095	244 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RSC9	Q03124	581 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RAD30	Q04049	632 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SMA2	Q04658	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RSF1	Q05043	376 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	STP3	Q05937	343 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	ARR1	Q06596	294 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	CBS1	P14066	229 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	VPS33	P20795	691 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CPR4	YCR069W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73

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