RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	SNC1	P31109	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ACB1	P31787	87 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MNS1	P32906	549 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	VAM7	P32912	316 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	DOA1	P36037	715 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ROT2	P38138	954 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MMS21	P38632	267 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YFL015C	P43578	164 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	TRS85	P46944	698 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YTP1	P53584	459 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
RPS1B	YML063W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	IRC4	Q03036	179 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	GIM5	Q04493	163 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	AIM33	Q04516	312 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	GRS2	Q06817	618 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	LDS2	Q08218	356 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	REX4	Q08237	289 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SEY1	Q99287	776 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	KIN3	P22209	435 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MXR2	P25566	168 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	UTR4	P32626	227 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SKN1	P33336	771 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	STP2	P38704	541 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PHO90	P39535	881 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	FAU1	P40099	211 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	HXT9	P40885	567 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ASI1	P54074	624 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MPS1	P54199	764 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	HXT11	P54862	567 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ECM29	P38737	1868 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	NUP1	P20676	1076 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MAK32	P23060	363 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ATP7	P30902	174 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MRPS5	P33759	307 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YMC2	P38087	329 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SUR2	P38992	349 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BDH2	P39713	417 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	HIT1	P46973	164 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YJL118W	P47022	219 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ORC5	P50874	479 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PMT5	P52867	743 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	LIF1	P53150	421 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YGR168C	P53293	376 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MKC7	P53379	596 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BIO4	P53630	237 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	GPI15	P53961	229 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RHO4	Q00246	291 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YDR387C	Q04162	555 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SWF1	Q04629	336 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	FUS2	Q05670	677 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SPO77	Q06134	477 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PIG1	Q06216	648 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MCH4	Q08268	501 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SGT1	Q08446	395 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	CSR2	Q12734	1121 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YSR3	P23501	404 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RBK1	P25332	333 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YCR006C	P25350	157 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YCR007C	P25354	239 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	DCC1	P25559	380 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ACP1	P32463	125 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	TOA2	P32774	122 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MRPL10	P36520	322 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ARP10	Q04549	284 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YOR029W	Q12243	111 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ATP6	P00854	259 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	OPI3	P05375	206 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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