RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YLR361C-AQ3E795 98 aa4.89□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-DR6P0CX70 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-ER1P0CX71 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-LR2P0CX72 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-PLP0CX73 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-JR1P0CX74 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-LR3P0CX75 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-ML2P0CX76 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CKA1P15790 372 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ZRC1P20107 442 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CAP1P28495 268 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W KKQ8P36004 724 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YPT53P36019 220 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W STS1P38637 319 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YIL067CP40514 678 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YNL184CP53876 108 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W EKI1Q03764 534 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YDR444WQ04093 687 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CSM3Q04659 317 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W DUS4Q06063 367 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W BSC6Q08280 497 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SRL2Q12020 392 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-GR1Q12085 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YBT1P32386 1661 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W IML1P47170 1584 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-DR4O74302 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-AP0CX57 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-PR1P0CX58 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-ORP0CX59 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-PR2P0CX60 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-DR5P0CX65 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-ER2P0CX66 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-GR3P0CX67 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-LR1P0CX68 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-MR2P0CX69 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W NUP1P20676 1076 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SCL1P21243 252 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MCM5P29496 775 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W HOG1P32485 435 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ISF1P32488 338 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W UPS2P35200 230 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W LAG1P38703 411 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPF1P38805 295 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W GLC8P41818 229 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-JR2P47099 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ECM27P47144 725 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W FLC3P53121 802 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MRH4P53166 561 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TIM13P53299 105 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W HXT15P54854 567 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-DR1Q03856 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W HOF1Q05080 669 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W AIM6Q07716 390 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-BRQ12217 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-NL2Q12470 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TY1A-GR2Q12485 440 aa4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RHO1P06780 209 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W FUN14P18411 198 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W COQ3P27680 312 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W NSG1P38837 291 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MIT1P40002 666 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PRM2P40534 656 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PMT6P42934 759 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W BST1P43571 1029 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W POP6P53218 158 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YGR079WP53249 370 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PDR16P53860 351 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W NUP49Q02199 472 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SEN15Q04675 128 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YMR253CQ04835 414 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YLR456WQ06199 204 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YPS7Q06325 596 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W TCO89Q08921 799 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W DDI2P0CH63 225 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W DDI3P0CH64 225 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W CYS4P32582 507 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W COS9P36034 407 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W AGP2P38090 596 aa4.87□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MIP6P38760 659 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51 ms