RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	DMD	P11532	3685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338		M0R296	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP3A4	P08684	503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PBX3	P40426	434 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCN3	P51790	818 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNC3	Q14003	757 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP6	Q16828	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	IER5L	Q5T953	404 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SUSD6	Q92537	303 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR182	O15218	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CPA1	P15085	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM189B	P81408	668 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZXDA	P98168	799 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LENG9	Q96B70	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RCAN1	P53805	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PKN1	Q16512	942 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	NID2	Q14112	1375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	EDIL3	O43854	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF862	O60290	1169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LAG3	P18627	525 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	UGCG	Q16739	394 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR16	Q569H4	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PSAP	P07602	524 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TEC	P42680	631 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF15	Q12870	199 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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