RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	ADAM2	Q99965	735 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	TLE6	Q9H808	572 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	LZTS1	Q9Y250	596 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF292	O60281	2723 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	PPFIA3	O75145	1194 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	CYP3A4	P08684	503 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	FGFR1	P11362	822 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	MICU3	Q86XE3	530 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	CASD1	Q96PB1	797 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCBP2-222	ENST00000552296	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	EDIL3	O43854	480 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	NEFL	P07196	543 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPN5	P54829	565 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	NAPA	P54920	295 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PKN1	Q16512	942 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	OSMR	Q99650	979 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	BARHL2	Q9NY43	387 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM186A	A6NE01	2351 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	GPR182	O15218	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	VTN	P04004	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	CDC27	P30260	824 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PRRX2	Q99811	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF302	Q9NR11	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	LAG3	P18627	525 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	AVPR2	P30518	371 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PBX3	P40426	434 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ADCY7	P51828	1080 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	LENG9	Q96B70	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PCBP2-222	ENST00000552296	NID2	Q14112	1375 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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