RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ARG80	P07249	177 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YER152C	P10356	443 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AHC2	P25649	128 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ASH1	P34233	588 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	CTF13	P35203	478 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YKL162C	P36052	402 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ATG12	P38316	186 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YEN1	P40028	759 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FAU1	P40099	211 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PAN6	P40459	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ZIM17	P42844	174 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SIP4	P46954	829 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ALY2	P47029	1046 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AMA1	P50082	593 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGR042W	P53227	271 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ROD1	Q02805	837 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SEN15	Q04675	128 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SSK1	Q07084	712 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SNA4	Q07549	140 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	UTR1	P21373	530 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RHB1	P25378	209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PEX34	P25584	144 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FLO10	P36170	1169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	APL3	P38065	1025 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YBL029W	P38201	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	POA1	P38218	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PNT1	P38969	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SUR2	P38992	349 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FET3	P38993	636 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ARG2	P40360	574 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ICE2	P40499	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GLC8	P41818	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PTR3	P43606	678 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TAH11	P47112	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	KTR6	P54070	446 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SLD5	Q03406	294 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LAP2	Q10740	671 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TIM9	O74700	87 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	REV1	P12689	985 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SNF6	P18888	332 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PAH1	P32567	862 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ROT2	P38138	954 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	VPS45	P38932	577 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HPA3	P39979	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PUS6	P53294	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GND2	P53319	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	BUD32	P53323	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YGR273C	P53329	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MRP51	Q02950	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	DCR2	Q05924	578 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ESC8	Q08119	714 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MDM12	Q92328	271 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	UBR1	P19812	1950 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	NAM2	P11325	894 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
SKG6	YHR149C	PDX1	P16451	410 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	PUP1	P25043	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	LAC1	P28496	418 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TCA17	P32613	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MSN4	P33749	630 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	MRPL4	P36517	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	FUI1	P38196	639 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	ATM1	P40416	690 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	TMA108	P40462	946 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKG6	YHR149C	BAP3	P41815	604 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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